《医源经旨》，八卷，明代余世用撰，成书于明万历三十四年（1606）。卷一为总论，凡67篇。卷二至卷八为各论，卷二列中风等8门，卷三列痰饮等14门，卷四列积聚等10门，卷五列脚气等13门，卷六列痔漏等16门，卷七列厉风等21门，卷八列幼科门总论等29门，凡111门。本次整理以上海图书馆所藏明崇祯四年（1631）刻本一孤本一为底本。《医源经旨》成书于明万历三十四年（1606）。全书总论67篇，各论111门，内容以编述为主，学术渊源大致属丹溪一派注重临床实用，理法相系，方药简明，是一部较好的综合性医书。此次整理以上海图书馆所藏明崇祯四年（1631）刻本为底本1.底本中繁体字改为规范简化字，加次现代标点2.底本中一般笔画之误，如“己”“已”不分等，予以径改，不出校3.底本中异体字、俗写字，以规范简化字律齐，不出注4.底本中通假字、古体字，保留原字，于首见处出注说明5.底本药名作非错误性异文者，保留原字，出注说明6.底本中重文符改为原字7.底本中明引前代文献，简注说明。其中引用与原文无差者，用“语出”；引用与原文有出入者，用“语本”。凡称引自某书而某书不见反见于他书者，用“语见8.底本无总目，有卷目，今删去卷目，据卷目编制总目置于正文前，与各卷篇题对勘并保持一致

《中国古医籍整理丛书·医经03：内经评文素问》为《内经评文》之一，与《内经评文灵枢》为姊妹篇，由清末著名医学家周学海撰。全书分为二十四卷，作者仿茅坤、储欣评《左传》《战国策》手法，对《黄帝内经素问》进行评注，每篇或旁注，或批注，或尾评，对文中疑问处精当校勘，并对文中义理加以阐发，以助读者理解，可师可法。本次整理以清光绪二十四年-1898）皖南建德周氏藏版《内经评文》单行本为底本。《内经评文》分为《内经评文素问》与《内经评文灵枢》两部分，为清·周学海所撰。周学海，字澄之。生于1856年，卒于1906年，安徽建德人（今东至县），清代著名医学家。他对中医学的重要贡献在于校勘评注古医籍，辑为丛书，推广流传。其主要著作收于《周氏医学丛书》。《内经评文》于清光绪二十四年（1898）初刻完成，分《内经评文素问》《内经评文灵枢》两部分。《内经评文素问》共二十四卷。《内经评文》初以单行本先行于世，后又收录于《周氏医学丛书》，所以《内经评文》有单行本和丛书本两种形式。现存版本有四种，均为清光绪二十四年皖南建德周氏藏版重印或影印而得。因单行本印刷最早，故该书印制精良，文字清晰，错漏之处甚少，为清代古医籍中的精刻本。所以，我们采用1898年最早刊行的《内经评文》单行本作为底本。参校本采用上海涵芬楼影印明顾氏翻宋本《重广补注黄帝内经素问》（简称顾本）；中国国家图书馆藏元读书堂刻本影印《新刊黄帝内经素问》（简称读书堂本）；上海涵芬楼《道藏》影印本《黄帝内经素问补注释文》，文物出版社、天津古籍出版社、上海书店联合出版1988年版（简称道藏本）。他校本采用晋·皇甫谧著，黄龙祥整理，人民卫生出版社2006年版《针灸甲乙经》（简称《甲乙经》）；隋·杨上善著，王洪图、李云点校，科学技术文献出版社2005年版《黄帝内经太素》（简称《太素》）；明-张介宾著，人民卫生出版社1965年版《类经》等。

《摄生总论》十二卷，清康熙年间王梅在明代张时彻所编《摄生众妙方》十一卷的基础上增补卷之一而成。《摄生总论》卷之一为秘授脉诀、诸药性赋、伤寒妙诀；卷之二至卷之十二为补养门、诸风门、伤寒感冒门、暑门、湿门、热门、诸血门、疟门、疫瘴门、霍乱门、痢疾门、脾胃门等四十七门书中“以人补人”之说，应以科学观点阅读本次整理以清康熙五十四年（1715）魏瑞昌刻本经术堂藏版为底本。

《妇科备考》，清代何应豫著。全书分四卷，卷一包括胎前章和产后章两部分内容，卷二为经产圆机，卷三为妇科说约及宜麟要策，卷四收载《中国古医籍整理丛书·女科06：妇科备考》临床诸方，并有回生丹方论。综观全书，论述详尽，每有独到之处。本次整理以清嘉庆二十五年（1820）刻本为底本。《妇科备考》为清代何应豫所著。《妇科备考》是集前贤医论之精华，并结合作者临证经验编撰而成的妇产科专著。该书文字浅显易懂，条理清楚，理论贴切，方全法备，用药精练，切合临床实际。《中国古医籍整理丛书·女科06：妇科备考》共四卷，其中卷一和卷三为医论，卷二和卷四辑录大量临床方剂，以备查考，取名为《妇科备考》。该书约于嘉庆二十五年庚辰（1820）初刊，次年清道光元年辛巳（1821）再刊。是书刊行后，流传广泛，现存两种版本。本次整理以内容完整，校勘审慎，镌刻工整，印刷清晰的清嘉庆二十五年庚辰（1820）刻本为底本，以清道光元年辛巳（1821）商城四本堂刻本为校本。

《本草便》，明代张懋辰撰。其人履迹未详。作者节选李杲的《药类法学》《用药法学》与王纶的《本草集要》，并兼收张元素、朱震亨等诸家关于本草的论述，对384味药物进行编撰、阐释而成。本次整理以浙江省图书馆藏明刻本影印本为底本

《中国古医籍整理丛书·医经02：内经评文灵枢》为《内经评文》之一，与《内经评文素问》为姊妹篇，由清末著名医家周学海撰。全书十二卷，作者按断句分节，并用圈点、旁批、夹批和总批形式，对各篇的布局格式、文法笔势等进行了评点，本次整理以清光绪二十四年-1898）皖南建德周氏藏版《内经评文》单行本为底本。

《中国古医籍整理丛书·临证综合06：医宗宝镜》清·邓复旦一生平不详一所撰。全书分四卷，其中卷一述药性，卷二列医方，卷三论诸证，卷四为脉学。本次整理以清嘉庆三年（1798）凌云楼刻本为底本。《中国古医籍整理丛书·临证综合06：医宗宝镜》为清代的一部综合性医书，旧题作“龙虎山张真人秘本”，具体成书年代不详。全书分为四卷，其中卷一述药性，卷二列医方，卷三论诸证，卷四为脉学，且各部分内容大都出自历代中医名著精华。其内容虽属转引荟萃，鲜有己见，然其编排自成一体，采摘广博精要，仍不失为一部医学入门及普及佳作。该书初刊于清嘉庆三年（1798），由凌云楼梓行，是为“清嘉庆三年戊午凌云楼刻本”；至清末由上海蜚英书局据初刻本石印出版发行，此即“清末上海蜚英书局石印本”（简称蜚英书局本）；民国时期则出现有“民国上海文瑞楼石印本”及“民国上海锦章书局石印本”两种版本，其流传也更为广泛，传世的印本数量颇丰。

《中国古医籍整理丛书·临证综合09：医学碎金》共四卷，明代医家周礼著。卷一概述人之孕育胚胎、五脏主五窍、五邪所乱、五劳所伤、五劳之疾等5卷二介绍人身之表里病见、治病举纲论、五脏四时更病、病机十九条等5卷三为五运化生、标本运气歌、五郁之发、五运主病等，卷四为诊脉法、诊四季脉法、七方十剂等内容。本次整理以明万历二十年（1592）虎林胡氏文会堂刻本为底本。《中国中医古籍总目》中收录了《医学碎金》两个版本，经实地调研发现两者为同一版本，即明万历二十年（1592）虎林胡氏文会堂刻本。清代时，出现了《医学碎金》的手抄本，系清人据胡氏文会堂刻本手抄而成。1989年中医古籍出版社出版了《寿养丛书》，内含《医学碎金》，系清人手抄本的影印本。1997年中国中医药出版社出版了《寿养丛书全集》，内含经校注的《医学碎金》。本次整理以明万历二十年（1592）虎林胡氏文会堂刻本为底本，中国中医药出版社出版的《寿养丛书全集》（其校勘的底本为清人的手抄本）中的校注本为主校本（简称“全集本”）校注而成。

《伤寒活人指掌补注辨疑》是明代伤寒学家童养学为纠正元代医家吴恕《伤寒活人指掌》之讹谬而著之伤寒学术著作。书凡三卷。首卷述六经传变。卷二列伤寒诸证一实际包括温病、疫疠和一些杂病一，其内容包含注解、辨证法、诊脉法、用药法（内含方剂）及总论等内容。卷三列方剂114首，是作者所一集得之古方一，其所选方剂与前两卷病证相对应。本次整理以明崇祯五年（1632）金陵刻本为底本。《伤寒活人指掌补注辨疑》之作者为明代童养学。童养学，字壮吾，明代建瓯人，贡生，任邵武儒学训导官，后为延平教授。他精于伤寒学，另著有《伤寒六经书纂要辨疑》。《伤寒活人指掌补注辨疑》一书，是童养学为纠正元代吴恕《伤寒活人指掌》之讹谬而著，属于伤寒学研究著作中的纠误之作。根据本次版本调研，《伤寒活人指掌补注辨疑》现存主要版本有：明崇祯五年壬申（1632）金陵刻本，清顺治十八年辛丑（1661）醉耕堂刻本，清乾隆三十七年壬辰（1772）抄本，清乾隆（具体时间不详）古越激东朱源抄本及清光绪十四年戊子（1888）刻本。本次校注整理，以明代崇祯五年壬申金陵刻本为底本，因为此版本系本书原刊，故以此本为底本。主校本选清顺治十八年辛丑醉耕堂刻本，因此本内容完整，又经过前人校对，故选为主校本（简称“顺治本”）。清光绪十四年戊子刻本年代较近，保存完好，刻工亦佳，字迹清晰，故选为参校本（简称“光绪本”）。

《内经运气病释》九卷，清代陆懋修著。前七卷专取《素问》运气七篇大论，以及《六节藏象论》中运气变化与疾病关系的原文，进行归类、注释、阐发，特别注重从运气角度解释病机、后二卷取宋代陈无择《三因极一病证方论》中的16首方剂、清代嘉庆年间缪问《司天方论》对方剂的分析书后附《内经遗篇病释》一卷，是对《素问》遗篇的病证注释、分述五疫推算机理又附《内经运气表》一卷，以13份表格演绎运气推算，本次整理以《世补斋医书》清光绪十年（1884）初刻本为底本。