明代芮经、纪梦德辑。共分八卷：卷一、卷二为总论部分，所收资料上自《内经》《难经》，中及汉唐，下逮宋金元明，尤以宋金元医家的医论文章汇集较多，并载有人体经脉穴位图；卷三载方药制度，论述外感、内伤等病因的脉证病治和方药；卷四至卷八为临床各科内容，记载了内科、五官科、小儿科、外科、妇科等病证的诊断和治疗经验。所载各证，先明病源，析其机理，继而辨脉理，随证施治，按治处方，间议药性及方药加减。本次整理以金陵书坊蒋氏石渠阁刻本为底本。

《中国古医籍整理丛书：弄丸心法》八卷，清乾隆间四川名医杨凤庭（瑞虞）著于乾隆二十四年（1759）。卷一、卷二讨论脉诀，卷三卷四论述医理、药性，卷五至卷七载录内科杂证，卷八介绍妇、儿科诸病证治。其医学思想最突出的特点就是强调辨证论治，随机应变，认为遣方用药当如以手弄丸圆转自如，不可泥古，并以此意命名其书。本次整理以宣统三年（1911）刻本为底本。

《中国古医籍整理丛书：删注脉诀规正》由清代名医沈镜于康熙三十二年（1693）撰。《中国古医籍整理丛书：删注脉诀规正》二卷，其内容大致可分为三大部分。第一部分为脏腑、脉象、诊候图和图解，以及相关脉诊知识。第二部分是对《王叔和脉诀》一书的主要歌诀进行注释、削正。第三部分主要以李时珍二十七脉歌、奇经八脉歌以及沈镜所补之脉歌为基本内容。本次整理以中国中医科学院收藏的清康熙庚辰三十九年刻本为底本。

《中国古医籍整理丛书：金匮要略直解》为《金匮要略》较早且较好的注本，后世注家多所引用。全书分上、中、下三卷，上卷自“脏腑经络先后第一”至“血痹虚劳第六”6篇，中卷自“肺瘘肺痈咳嗽上气第七”至“惊悸吐衄下血胸满瘀血第十六”10篇，下卷自“呕吐哕下利第十七”至“果实菜谷禁忌第二十五”9篇，书前有李锦、曹溶、程应旄三家之序及林亿“金匮要略方论序”等。本次整理以清康熙十二年（1673）刻本为底本。

《中国古医籍整理丛书：坤元是保》系南宋薛轩辑，由卷上、卷下、续集组成。卷上阐述女科理法，内容丰富，其中调经、胎前、产症、产后、杂症为《中国古医籍整理丛书：坤元是保》的核心内容。卷下记载郑氏女科的重要方剂，以“丁仙现·绛都春”词编号，列方100首。续集列方108首。本次整理以上海图书馆藏小楷本为底本。

《伤寒指归》清代医家戈颂平著，是对《伤寒论》条文逐字逐句释义，推理穷源，结合作者个人心得并旁征博引加以论述，所论颇多独到见解的一部伤寒学专著。《中国古医籍整理丛书：伤寒指归》共计10册。本次整理以光绪十一年稿本为底本。

《中国古医籍整理丛书：伤寒撮要》共分六卷，卷一总论，简要阐述全书大意宏旨。卷二至卷六序贯相连。卷一述伤寒识病；卷二列伤寒六经病证治、变证治法及禁忌；卷三论正伤寒、相类伤寒、伤寒变病及治疗；卷四、卷五仍为伤寒变病及治疗；卷六列伤寒用方449首。《中国古医籍整理丛书：伤寒撮要》本次整理以明隆庆一年（1576）新安汪滋刻本为底本。

《温证指归》清代周魁撰，成书于嘉庆四年（1799）。全书共4卷。卷一阐述温病的基本理论，计21篇。对温病的基本概念、发病特点、发病规律及其治则治法进行了全面客观的说明和总结。卷二详载温病发病时各种证候变化、辨证要点、病机、与他病的鉴别以及治疗所用的方剂等，计61篇。卷三汇选治疗温证所使用的方剂，总计正方115首，附方18首。卷四为其搜集整理的16则典型温病病案。本次整理以足抄本为底本。

《中国古医籍整理丛书：思济堂方书》乃贾氏“五十年专心医理，博览群书，敷轩岐之至理，集圣哲之大成”。是书凡五卷，言简而理约，道明而贯通，选方精要实用。所辑诸方多为历代临床所常用，大多属于药味精炼、药性平和、疗效可靠者。本次整理以珍泰斋贾宅藏版刻本为底本。

《中国古医籍整理丛书：本草汇笺》清代顾元交撰，成书于清康熙五年（1666）。正文凡十卷，前附“天元芥说”，概述五运六气，包括五运说、六气说、一气中有五运一运中有六气说、主气说、客气说、四间气说、天地皆左旋说等文15篇。正文共载药397种，附药图264幅（多为药材图）。正文后附“总略”，为作者概述诸家本草理论及用药观点，包括论本草为历代医学之本、论药性气味生成原本、论药性同味而用殊、论药性偏胜之弊等文15篇。本次整理以清康熙五年（1666）龙耕堂本为底本。