环境微生物实验教程

环境微生物实验室安全须知 / 1
第一部分? 基础微生物实验方法与技术 / 5
第一章? 培养基的配制及灭菌消毒 / 7
实验 1-1 培养基的种类与常规配制程序 / 8
实验 1-2 实验室常用培养基的配制程序 / 20
实验 1-3 培养基及器皿的消毒和灭菌程序 / 27
第二章? 无菌操作、接种技术和培养方法 / 35
实验 2-1 无菌环境的创建及无菌操作技术 / 36
实验 2-2 微生物接种技术 / 46
实验 2-3 微生物培养方法 / 58
第三章? 微生物的分离纯化与鉴定技术 / 65
实验 3-1 环境中异养微生物的分离与纯化 / 67
实验 3-2 环境中自养微生物的分离与纯化 / 76
实验 3-3 环境中功能菌的筛选、分离与纯化 / 82
第四章? 微生物形态观察、大小与数量测定 / 87
实验 4-1 微生物形态的观察 / 88
实验 4-2 微生物大小测定 / 100
实验 4-3 微生物数量测定 / 107
第五章? 微生物生长因子的测定 / 113
实验 5-1 微生物生长曲线的测定 / 114
实验 5-2 环境因子对微生物生长的影响 / 119
实验 5-3 营养盐对微生物生长的影响 / 125
第六章? 微生物菌种保藏及分子鉴定技术 / 131
实验 6-1 微生物菌种保藏技术 / 132
实验 6-2 微生物的分子鉴定方法 / 143
第二部分? 现代微生物实验方法与技术 / 149
第七章? 环境微生物遗传物质提取、PCR 扩增与电泳分析 / 151
实验 7-1 环境微生物宏基因组总 DNA 提取和浓度测定 / 152
实验 7-2 环境微生物宏转录组总 RNA 提取和浓度测定 / 159
实验 7-3 琼脂糖凝胶电泳分析技术 / 164
实验 7-4 环境微生物宏蛋白组总蛋白质的提取和浓度测定 / 169
实验 7-5 SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳分析技术 / 175
实验 7-6 聚合酶链式反应（PCR）技术 / 182
第八章? 基于荧光的环境微生物分析技术 / 189
实验 8-1 荧光原位杂交（FISH）技术 / 190
实验 8-2 荧光定量 PCR 技术 / 197
第九章? 基于高通量测序的环境微生物分析技术 / 205
实验 9-1 宏基因组测序技术 / 206
实验 9-2 宏转录组测序技术 / 212
实验 9-3 宏蛋白质组测序技术 / 217
第十章? 基于生物信息学的环境微生物群落与功能分析技术 / 223
实验 10-1 Linux 系统操作基础 / 224
实验 10-2 16S rRNA 细菌多样性分析方法 / 231
实验 10-3 基于宏基因组的环境微生物群落功能分析 / 242
实验 10-4 基于宏转录组的环境微生物群落功能和表达量分析 / 257
实验 10-5 基于宏蛋白质组的环境微生物群落功能和表达量分析 / 271
第三部分? 环境微生物及其应用 / 283
第十一章? 微生物与环境监测 / 285
实验 11-1 水体中细菌总数测定 / 286
实验 11-2 水体中粪大肠菌群的测定 / 292
实验 11-3 土壤中微生物呼吸的测定 / 297
实验 11-4 公共场所空气中微生物数量的测定 / 303
第十二章? 微生物与污水处理 / 307
实验 12-1 序批式活性污泥法（SBR）处理生活污水 / 308
实验 12-2 曝气生物滤池处理生活污水 / 316
参考文献 / 322