R语言及其医学应用

　　R语言是具有强大数据分析和可视化功能的统计分析软件，已成为医学领域数据分析和可视化的重要工具。本书分11章介绍R 语言及其医学应用，包括R语言简介、R语言的数据结构、读写数据与程序、数据预处理等；同时介绍了基于R语言的数据可视化，包括使用R语言绘制条形图、饼图、直方图、盒形图，以及涉及的图形导出和par（）函数、plot（）函数操作，及使用ggplot2包绘制散点图、条形图、盒形图、小提琴图、直方图、密度图、韦恩图和热图等。此外，本书还重点介绍了基于R语言的医学大数据分析方法，包括常用描述统计量和分类变量列联表统计点、总体均数估计、假设检验、t检验、方差分析、卡方检验和非参数检验、多重回归分析、生存分析等，具有较强的实用性。本书可供高等医药院校临床医学、公共卫生及其他相关专业本科生和研究生，以及医药卫生管理人员使用，亦可供数据分析师、统计学及大数据挖掘从业人员学习参考。

　　王廷华，医学博士，留法博士后，教授，教YU部新世纪优秀人才，享受国务院政府特殊津贴，四川大学特聘教授，生物治疗国家重点实验室博士生导师，昆明医科大学实验动物学部主任（兼），神经科学研究所所长。现任世界中医药联合会中国综合医院委员会副主任委员，中国研究型医院神经再生与修复委员会常委，中国解剖学会理事，神经解剖专业委员会委员。主持国家级、省部级等20余个项目，获中华医学三等奖1项，省部级自然科学与科技进步二等奖4项、三等奖5项，主编著作23部、教材4部，教YU部长江学者评审专家。在国际高水平学术期刊Nature Communication等发表英文论文203余篇（通信181篇），中文论文400余篇；获授权专利11项。何蓉，计算机应用专业硕士，副教授，中华医学会教育技术分会委员。长期从事计算机技术及编程工作，主讲数据库原理、数据结构和大学计算机基础等课程，现为昆明医科大学实验动物学部信息中心数据分析师，主编著作3部，发表论文10余篇。

 
目录
 
第1章R语言简介(1)
 
11R语言(1)
 
12RStudio(6)
 
13R语言初探(7)
 
14查看R语言提供的文档(9)
 
 
第2章R语言的数据结构(12)
 
21R语言的一些基本语法(12)
 
22R语言的基本运算(14)
 
23向量(16)
 
24矩阵(21)
 
25数组(25)
 
26数据框(27)
 
27列表(29)
 
28因子(32)
 
29不同数据结构间的转换(35)
 
 
第3章读写数据与程序(36)
 
31R语言内置数据集(36)
 
32数据的输入(38)
 
33数据的输出(44)
 
34控制结构(46)
 
35函数定义(48)
 
 
第4章数据预处理(51)
 
41用基本包处理数据框(51)
 
42用dplyr包处理数据框(62)
 
43数据框的合并(66)
 
44缺失值的处理(71)
 
45大数据的处理策略(78)
 
 
第5章R语言初级绘图(81)
 
51条形图(81)
 
52饼图(84)
 
53直方图(86)
 
54盒形图(87)
 
55图形的导出(89)
 
56par()函数详解(92)
 
57plot()函数(99)
 
 
第6章R语言高级绘图(101)
 
61ggplot2包绘图(101)
 
62其他图形绘制(116)
 
 
第7章探索性数据分析(120)
 
71常用描述统计量(120)
 
72分类变量的列联表统计(126)
 
 
第8章常见统计分析(130)
 
81总体均数的估计(130)
 
82假设检验(133)
 
83t检验(136)
 
84方差分析(142)
 
85卡方检验(146)
 
86非参数检验(155)
 
 
第9章回归分析(163)
 
91简单线性回归(163)
 
92变量间的相关性(169)
 
93多重线性回归分析(171)
 
 
第10章Logistic回归分析(185)
 
101二分类的多重Logistic回归(185)
 
102无序多分类反应变量的Logistic回归(194)
 
103有序多分类反应变量的Logistic回归(198)
 
 
第11章生存分析(208)
 
111生存分析的方法(208)
 
112生存曲线的估计和比较(210)
 
113Cox回归(215)