磁共振成像数据分析与应用

　　本书是一本关于磁共振成像（MRI）数据分析及案例展示的工具书。全书分为九章，分别对结构磁共振成像（sMRI）、弥散张量成像（DTI）和功能磁共振成像（fMRI）的成像原理、图像采集、相关软件安装及操作，基于VBM、SBM、VBA、TBSS、功能连接和基于图论的脑网络分析等分析手段，并结合阿尔茨海默病、帕金森、精神分裂症、抑郁症、双向情感障碍和自闭症等疾病和其他认知相关研究的**的研究成果等内容进行详细的讲解。本书以磁共振数据分析为核心，基于结构磁共振和功能磁共振的不同处理软件和相关算法，全面阐述了不同序列的磁共振数据的处理与统计分析，提供了大量已报道的经典文献案列，给读者带来MRI理论和数据分析上的革新内容。本书内容全面，通俗易懂，适合于磁共振、心理学、神经科学、神经病学、统计学、生物信息学和计算机科学等领域的学生和研究人员学习参考。

　　王廷华，四川大学华西医院教授，四川大学转化神经科学中心常务副主任、昆明医科大学神经科学研究所所长。四川大学华西医院一层次引进人才，教育部新世纪优秀人才，中国研究型医院神经损伤修复委员会常委，中国解剖学会理事。主要从事脑肺保护转化医学与麻醉药网络机制研究。主持国家自然科学基金5项，国家科技部项目1项，教育部重点及面上项目4项，四川省科技厅重点项目1项，生物医学重大专项1项；获省部级科学二等奖2项，科技进步二等奖2项及教育部科技成果1项，发表SCI论文168篇，主编“生物技术系列丛书”、《器官•疾病比较图谱》等著作20部，作为导师培养博士生38人，硕士生60余人，指导本科生论文33人，授权专利6项。廖承德，云南省肿瘤医院影像科副主任，教授，硕导。熊柳林，遵义医科大学附属医院麻醉科副主任，副主任医师，硕导。朱高红， 昆明医科大学附属医院核医学科，主任，教授，博导。

绪论1
节磁共振成像发展历史1
第二节磁共振成像分析简史5
第三节磁共振成像主要研究内容37
第四节磁共振成像在神经科学中的应用38
第五节磁共振成像与其他学科的联系38
章磁共振成像原理40
节磁共振成像基本原理40
第二节扫描参数的质量控制43
第三节脉冲序列43
第四节常用成像技术44
第二章人、大鼠和树鼩脑正常结构48
节正常人脑解剖结构48
第二节正常人脑磁共振成像结构50
第三节正常大鼠脑解剖结构53
第四节正常大鼠脑磁共振成像结构55
第五节正常树鼩脑解剖结构55
第六节正常树鼩脑磁共振成像结构58
第三章软件介绍与安装60
节MATLAB下载安装与简单操作60
第二节ITKSNAP下载安装与简单操作68
第三节SPM下载安装与载入71
第四节FSL下载安装与简单操作76
第五节AFNI下载安装与简单操作79
第六节FreeSurfer下载安装与简单操作81
第七节MRIcro下载安装与简单操作83
第八节DTI Studio下载安装与简单操作85
第四章基于体素的形态学分析86
节数据预处理与软件准备86
第二节图像分割86
第三节创建模板91
第四节皮质、白质和脑脊液统计计算93
第五节变换到标准空间94
第五章弥散张量成像数据分析96
节脊髓弥散张量成像数据分析96
第二节脑弥散张量成像数据分析102
第六章静息态功能磁共振成像数据处理103
节数据预处理103
第二节频域信号分析（ALFF、fALFF）108
第三节局部一致性分析（ReHo）111
第四节功能连接分析114
第七章经典范例展示116
节磁共振成像在精神分裂症中的应用116
第二节磁共振成像在抑郁症中的应用135
第三节磁共振成像在双相情感障碍中的应用154
第四节磁共振成像在阿尔茨海默病中的应用170
第五节磁共振成像在帕金森病中的应用181
第六节磁共振成像在自闭症中的研究189
第八章基于磁共振的用于疾病诊断和分类的模型构建201
节基于磁共振的用于疾病诊断和分类的模型构建201
第二节基于深度学习框架构建的经典范例230
第九章医学图像在线数据库243
节The Cancer Imaging Archive（TCIA）243
第二节Information Extraction from Images（IXI）246
第三节MultiModel MRI Reproducibility Resource（MMRR）248
第四节International Neuroimaging DataSharing Initiative（INDI）249
第五节Open Access Series of Imaging Studies（OASIS）250
第六节MIDAS251