RNA甲基化表观转录组学

　　表观遗传学修饰包括DNA、RNA和蛋白质的化学修饰，基于非序列改变所致基因表达和功能水平变化。近年来基于DNA和蛋白质修饰，可逆RNA甲基化修饰研究引领第三次表观遗传学修饰研究浪潮。RNA存在150余种化学修饰，甲基化是最主要的修饰形式。鉴定RNA甲基化修饰酶及研发其转录组水平高通量检测技术，是揭示RNA化学修饰调控基因表达和功能规律的基础。本书总结了近年来中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）杨运桂研究团队与合作者及国内外同行在RNA甲基化表观转录组学研究中取得的主要前沿进展，拓展了RNA甲基化表观转录组学研究新领域，丰富了中心法则表观遗传学规律。具体研究进展包括发现RNA去甲基酶（eraser）、甲基转移酶（writer）和结合蛋白（reader），揭示RNA甲基化修饰调控造血干细胞定向分化、精子发生和发育等重要生命进程及疾病发生等，证明RNA甲基化修饰类似于DNA甲基化，具有可逆性。

　　杨运桂博士，中国科学院特聘研究员。1995年本科毕业于复旦大学生命科学学院；2000年博士毕业于中国科学院上海药物研究所；2000—2005年为法国世界卫生组织国际癌症研究署（International Agency for Research on Cancer）博士后／Staff Scientist；2005—2008年为英国癌症研究署C1are Hall实验室（Clare Hall Laboratories）博士后；2008年至今为中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）研究员。2016年获国家杰出青年科学基金资助，2019年获谈家桢生命科学创新奖，2020年当选欧洲科学院院士。致力于RNA表观遗传学规律研究，参与发现了RNA甲基化可逆性规律及其重要生理功能和病理效应，拓展了表观转录组学前沿领域。

第1章 RNA去甲基化酶
1.1 FTO：第一个RNA m6A去甲基化酶
1.2 FTO参与mRNA选择性剪接并调控脂肪前体细胞分化
1.3 ALKBH5：第二个RNA m6A去甲基化酶
1.4 国内外研究进展
参考文献
第2章 RNA甲基转移酶
2.1 WTAP是RNA甲基转移酶复合物的调控亚基
2.2 RNA m6A甲基化修饰生成受miRNA调控并促进千细胞重编程
2.3 NSUN2催化mRNA上m5C的形成
2.4 国内外研究进展
参考文献
第3章
RNA甲基结合蛋白
3.1 细胞核m6A结合蛋白YTHDC1参与调控前体mRNA选择性剪接
3.2 细胞质m6A结合蛋白YTHDF3促进mRNA翻译
3.3 细胞核内的m5C结合蛋白ALYREF调控mRNA出核运输
3.4 RNA m5C修饰结合蛋白YBX1调控膀胱癌增殖和转移
3.5 国内外研究进展
参考文献
第4章 RNA甲基修饰调控造血干细胞定向分化
4.1 m6A调控斑马鱼胚胎造血千细胞分化
4.2 m6A调控小鼠胚胎造血干细胞分化
4.3 国内外研究进展
参考文献
第5章 RNA甲基化修饰调控精子发生
5.1 ALKBH5介导的m6A调控小鼠精子发生
5.2 METTL3介导的m6A修饰调控精原千细胞分化和减数分裂起始过程
5.3 国内外研究进展
参考文献
第6章 RNA甲基化修饰调控发育
6.1 RNA甲基化修饰在中枢神经系统发育中的功能
6.2 m6A结合蛋白PRRC2A调控少突胶质细胞的特化
6.3 RNA甲基化调控斑马鱼母源mRNA稳定性机制
6.4 国内外研究进展
参考文献
第7章 RNA甲基化修饰调控水稻高温适应性
7.1 OsNSUN2作为水稻mRNA m5C甲基转移酶
7.2 osnsun2突变体中光合系统发生缺陷
7.3 mRNA m5C促进蛋白翻译效率
7.4 国内外研究进展
参考文献
第8章 FTO化学抑制剂恩他卡朋介导代谢调控
8.1 结构虚拟筛选方法鉴定FTO潜在化学抑制剂一恩他卡朋
8.2 恩他卡朋通过抑制FTO影响FOXO1表达调控糖脂代谢
8.3 国内外研究进展
参考文献
第9章 RNA甲基化前沿研究展望
9.1 其他RNA修饰
9.2 展望
参考文献
索引