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功能基因组学统计方法
作者:王琳,李雷 著
出版社:中国统计出版社
出版时间:2016-05-01
ISBN:9787503777561
定价:¥33.00
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内容简介
《功能基因组学统计方法》详细地介绍了作者在解析复杂疾病分子机制的功能性基因组学统计方法方面的相关工作,全书共分为六章。第一章:基因芯片数据的正规化,介绍了一些常用的基因芯片数据正规化方法,并着重介绍了作者提出的利用简单线性样条模型进行基因芯片子块正规化的方法,以及利用基因表达差异值的核密度估计图来评价正规化效果的方法。第二章:基因表达数据的统计推断,主要包括基因富集分析和转录因子调控推断两部分内容,基因富集分析部分介绍了一些常用的基因富集分析方法,并详细介绍了作者推荐使用的Wilcoxon秩和得分检验方法,转录因子调控推断部分介绍了一些常用的转录因子调控推断方法,并着重介绍了作者在改进BASE方法的基础上提出的BASE2.O方法。第三章:基因芯片数据分析的整体思路和框架,介绍了基因芯片数据分析的流程和整体思路。第四章: [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究简介,介绍了新型纳米粒子[Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究的研究背景、研究成果综述,以及基因芯片实验的实验方案和实验数据。第五章:[Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的基因芯片数据正规化,介绍了新型纳米粒子[Gd@C82 (OH)22]n抗癌机制研究中的基因芯片正规化方法以及正规化的效果。第六章:[Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的统计推断,介绍了新型纳米粒子[Gd@C82 (OH)22]n抗癌机制研究中的基因富集分析和转录因子调控推断分析,并得出了很多有意义的生物结论,揭示了新型纳米粒子[Gd@C82(OH)22]n治疗癌症的重要机理,为[Gd@C82(OH)22]n的临床应用提供了理论依据。《功能基因组学统计方法》的这些研究结果为复杂疾病分子机制的研究提供了有效的工具和手段。
作者简介
王琳,首都经济贸易大学统计学院讲师。2009年毕业于南开大学数学科学学院数学与应用数学专业,获理学学士学位;同时获天津大学工商管理专业管理学学士学位。2014年毕业于中国科学院数学与系统科学研究院概率论与数理统计专业,获理学博士学位。2015年8月-2016年8月在美国匹兹堡大学做访问学者。研究方向涉及生物信息学和计算生物学等领域,主要包括功能基因组数据分析和数据整合分析研究等。李雷,中国科学院数学与系统科学研究院研究员。1998年获得美国加州大学伯克利分校统计系博士学位;2000年秋季在加利福尼亚大学洛杉矶分校纯粹与应用数学研究所做博士后。2002-2010年在南加利福尼亚大学计算生物及数学系任教并于2005年获终身职务。2010年入选中国科学院“百人计划”。
目录
第1章 基因芯片数据的正规化
1.1 基因芯片技术简介
1.2 基因芯片数据正规化的动机
1.3 基因芯片数据正规化的方法
1.4 基因芯片数据正规化的评价
第2章 基因表达数据的统计推断
2.1 基因富集分析
2.2 转录因子调控推断
第3章 基因芯片数据分析的整体思路和框架
第4章 [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究简介
4.1 [Gd@C82(OH)22]n简介
4.2 乳腺癌简介
4.3 [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究成果综述
4.4 [Gd@C82(OH)22]n抗乳腺癌研究的基因芯片实验
4.5 [Gd@C82(OH)22]n抗乳腺癌研究的qRT-PCR实验
第5章 [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的基因芯片数据正规化
5.1 基因芯片数据正规化的动机
5.2 利用简单线性样条模型进行基因芯片子块正规化
5.3 基因芯片数据正规化的评价
5.4 从基因芯片正规化的结果看[Gd@C82(OH)22]n的低毒性
第6章 [Gd@c82(OH)22]n抗癌机制研究中的统计推断
6.1 基因富集分析
6.2 转录因子调控推断分析
6.3 内质网应激、TP53、细胞凋亡三者之间的关系
附录A [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的基因芯片数据正规化结果
附录B 术语词汇表
参考文献
后记
1.1 基因芯片技术简介
1.2 基因芯片数据正规化的动机
1.3 基因芯片数据正规化的方法
1.4 基因芯片数据正规化的评价
第2章 基因表达数据的统计推断
2.1 基因富集分析
2.2 转录因子调控推断
第3章 基因芯片数据分析的整体思路和框架
第4章 [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究简介
4.1 [Gd@C82(OH)22]n简介
4.2 乳腺癌简介
4.3 [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究成果综述
4.4 [Gd@C82(OH)22]n抗乳腺癌研究的基因芯片实验
4.5 [Gd@C82(OH)22]n抗乳腺癌研究的qRT-PCR实验
第5章 [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的基因芯片数据正规化
5.1 基因芯片数据正规化的动机
5.2 利用简单线性样条模型进行基因芯片子块正规化
5.3 基因芯片数据正规化的评价
5.4 从基因芯片正规化的结果看[Gd@C82(OH)22]n的低毒性
第6章 [Gd@c82(OH)22]n抗癌机制研究中的统计推断
6.1 基因富集分析
6.2 转录因子调控推断分析
6.3 内质网应激、TP53、细胞凋亡三者之间的关系
附录A [Gd@C82(OH)22]n抗癌机制研究中的基因芯片数据正规化结果
附录B 术语词汇表
参考文献
后记
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