猪、鸡重要经济性状遗传的分子机制

　　本专著通过功能基因组学、比较基因组学、生物信息学和表观遗传学等研究方法，针对猪、鸡品质、遗传抗性、生长、繁殖等典型的复杂性状，定位、分离和克隆影响这些复杂经济性状的基因和基因网络，阐明其形成和调控这些复杂经济性状表型的分子遗传机理。同时，研制了高通量基因型诊断技术平台，发展优质基因的平衡集成方法，提出了系统平衡育种理论。包括7个板块的研究内容：1.生长发育性状的功能基因组；2.品质性状形成的分子基础；3.繁殖性状形成的遗传机理；4.抗病和抗逆基因的克隆分析；5.重要复杂性状比较基因组；6.表观遗传和miRNA影响性状形成的机制；7.重要经济性状的分子改良。

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前言
第一章 猪、鸡生长发育的功能基因组
第一节 猪、鸡肌肉生长发育相关机制的研究
一、采用组学方法对猪、鸡肌肉生长发育分子机制的研究
二、采用候选基因方法对猪、鸡肌肉生长发育性状的研究
第二节 猪、鸡脂肪生长发育的功能基因研究
一、猪的Caveolin,基因家族
二、猪Wnt信号通路和microRNA在调控脂肪生成中的作用
三、脂蛋白脂肪酶基因多态性与脂肪性状关联分析
第三节 猪、鸡性腺对生长发育调控的研究
一、雄性性腺对猪肌肉和脂肪组织生长发育调控的研究
二、性腺对公鸡生长发育影响的研究
第四节 藏鸡低氧适应机制的研究
一、采用组学方法对藏鸡低氧适应机制的研究
二、采用候选基因法对藏鸡低氧适应性机制的研究
参考文献
第二章 猪、鸡品质性状形成的分子机制
第一节 猪品质性状形成的分子机制
一、部分地方品种和引进品种肉质性状测定
二、品质差异品种和不同生长发育阶段组织中基因表达差异研究
三、猪肌肉组织差异蛋白质组学研究
四、猪品质性状的候选基因和分子标记研究
五、猪品质性状相关印记基因的研究
六、猪肌肉细胞系的建立以及品质性状相关基因的RNA干扰研究
七、复杂性状与基因组多位点的关联分析方法研究
第二节 鸡品质性状形成的分子机制
一、蛋品质性状测定与遗传参数估计
二、应用高通量的检测方法筛选蛋品质性状候选基因
三、鸡蛋鱼腥味易感基因FM03的研究
四、鸡脂肪代谢功能基因的研究
五、鸡肌纤维发育的分子机制研究
参考文献
第三章 繁殖性状形成的遗传机制
第一节 家猪繁殖性状基因位点的遗传解析
一、大规模“白色杜洛克猪×二花脸猪”F2/F3资源群体的构建及繁殖性状表型测定
二、遗传图谱的构建和QTL定位统计分析
三、繁殖性状QTL定位
四、繁殖性状QTL精细定位和候选基因研究
五、母猪杀婴行为表型极端个体下丘脑差异表达基因的分离
六、候选基因影响母猪杀婴行为的表观遗传机制研究
第二节 性别决定、分化及生殖细胞的发育
一、性别决定和分化的机制
二、雄性生殖细胞的发育
三、雌性生殖细胞的发育
小结
参考文献
第四章 抗病和抗逆基因的克隆分析
第一节 猪免疫性状的QTL精细定位
一、猪资源群体的构建
二、资源群体免疫性状的测定与分析
三、猪免疫指标QTL全基因组扫描分析
四、后续研究：基于高密度SNP芯片的全基因组关联分析
第二节 猪腹泻抗性基因的克隆分析
一、F4体外黏附表型
二、SSH差异表达基因分析
三、腹泻候选基因Muc4关联分析
四、F4受体基因精细定位
五、大肠杆菌K88ad受体全基因组扫描
六、大肠杆菌F18受体候选基因a1-岩藻糖转移酶基因分析
七、K88ac受体候选基因Muc4突变与表达的关系
八、差异蛋白质组学方法，筛选腹泻候选基因
九、后续研究：大肠杆菌F4和F18受体候选基因Muc4、FUT1基因功能验证
第三节 猪抗病、抗逆候选基因的克隆分析
一、CD14基因的克隆、定位、组织表达
二、TLR4基因的定位、组织表达
三、SLC11A和BPI基因的组织表达及与免疫性状关联分析
四、低分子质量多肽2、低分子质量多肽7（LMP2、LMP7）基因的克隆分析
五、MECL-1的克隆分析
六、猪能量代谢功能基因的克隆分析
……
第五章 重要复杂性状的比较基因组
第六章 表观遗传和miRNA影响性状形成的机制
第七章 鸡、猪重要经济性状的分子改良
图版