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中国大麦a-淀粉酶活性分析
作者:姜晓东,陈卫国 著
出版社:中国农业科学技术出版社
出版时间:2013-05-01
ISBN:9787511612786
定价:¥25.00
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内容简介
本书为了解中国大麦地方品种的遗传多样性,为大麦α-淀粉酶活性基因寻找有效的分子标记。利用覆盖全基因组的41对简单重复序列(SSR)标记引物,对257份中国大麦地方品种进行PCR扩增;采用Nei’s遗传距离和邻接(neighbour-joining)法进行聚类分析;在对群体结构和连锁不平衡分析的基础上,进行基于全基因组的表型与基因型的关联分析。共鉴定出709个等位变异,平均每个位点的等位变异数为17个。41个SSR标记位点的多态性信息指数(PI)变化范围为0.23(Bmag 0385)—0.94(Bmac0032),平均为0.6385。257个中国大麦地方品种聚合成9个不同的结构类群,发现5个与大麦α-淀粉酶活性显著关联的标记位点。中国大麦地方品种中蕴藏着丰富的遗传等位变异;各类群的特性和品种来源符合“遗传关系密切、表型特征特性相同、地理生态相近”的同类群聚集规律。
作者简介
姜晓东资深微软技术专家和系统架构师,对.NET体系架构、C#、CIL、Win32平台都有较深入的研究。著名微软技术讲师,在江西微软技术中心主讲软件设计(UML和设计模式)和.NETFrarrleWork方面的课程,曾在微软区域技术中心的“周五讲坛”主讲C#和WindowsMobile开发方面的课程,并获得“最佳讲师”称号。多年来一直活跃在研发一线,具有多年的项目研发经验,曾参与了财政工程项目、国家863软件项目以及电子基金项目的研发,在桌面应用和Web应用方面都积累了丰富的实践经验。CSDN的元老级会员,51 CTO的技术博客专家,对lT技术的发展方向有独到的见解,近期关注HTML 5和移动开发。
目录
第一章 α-淀粉酶酶活性的研究
第一节 α-淀粉酶家族蛋白结构、酶切及底物的特异性结合特性综述
1.1 淀粉酶的研究进展
1.2 α-淀粉酶反应机理
1.3 淀粉识别和淀粉结合结构域(sBD)
1.4 大麦α-淀粉酶同工酶特性的研究
第二节 Amy32b基因的遗传多样性及其对α-淀粉酶活性的影响
1 材料与方法
1.1 植物材料
1.2 LB液体培养基
1.3 方法
1.4 引物设计及基因扩增
1.5 重组蛋白表达的诱导
2 结果
2.1 Amy32b的遗传多样性
2.2 Amy32b的等位基因分布
3 讨论
3.1 Amy32b的遗传多样与α-淀粉酶基因活性
3.2 Amy32b的遗传多样性分布与进化
4结论
第二章 关联分析在植物中的应用
第一节 关联分析概述
1.1 配子相的不平衡
1.2 标记与性状问的关联方法
1.3 关联分析基因型的确定与研究进展
1.4 关联分析在人类疾病研究的现状及展望
1.5 关联作图在植物中的应用
第二节 中国大麦地方品种的遗传多样性及α-淀粉酶活性的全基因组关联
分析
导言
1 材料与方法
1.1 作图群体与表型性状
1.2 SSR分子标记分析
1.3 基因型分析
1.4 群体结构分析
1.5 关联分析及等位效应分析
2 结果
2.1 SSR标记位点的遗传多样性
2.2 中国大麦地方品种的聚类分析
2.3 群体结构分析
2.4 连锁不平衡分析
2.5 与α-淀粉酶活性关联的SSR位点
2.6 SSR关联位点等位变异的表型效应值及等位变异平均效应
3 讨论
3.1 中国大麦地方品种遗传多样性及其分布
3.2 α-淀粉酶活性的关联分析定位
4 结论
第三章 植物赤霉素与α-淀粉酶基因的表达
第一节 植物中赤霉素(GA)信号转导的分子机理
1 通过对赤霉素响应突变体的突变鉴定赤霉素信号转导中的组件
1.1 赤霉素信号转导图途径中的正向调节因子
1.2 赤霉素信号中转导途径中的抑制调节因子
1.3 拟南芥中赤霉素信号转导途径的模式
1.4 水解酶的顺式作用元件
第二节 大麦α-淀粉酶基因Amy6-4表达模式的半定量RT-PcR分析
1 材料与方法
1.1 RNA提取和cDNA第一链合成
1.2 cDNA第一链合成
l 3 引物设计
1.4 PCR循环数的确定
2 结果与分析
2.1 RNA提取
2.2 半定量RT-PcR循环数的确定
2.3 不同发芽时间Amy6-4基因表达
3 结论与讨论
第四章 淀粉的生物降解与∞淀粉酶活性的研究
第一节 植物中淀粉的生物降解
1 α-淀粉酶的酶学特性
2 功能性α-淀粉酶基因的表达
3 脱支酶(DEB)、β-淀粉酶和α-葡聚糖酶
3.1 脱支酶
3.2 β-淀粉酶
3.3 α-葡萄糖苷酶
4 马铃薯贮藏淀粉的降解
5 拟南芥叶片中同化淀粉的降解
6 谷物细胞中的淀粉降解
7 质体蛋白作用新靶向途径
第二节 中国大麦地方品种的α-淀粉酶酶活性研究
1 材料与方法
1.1 试验材料和田间试验
1.2 α-淀粉酶活性测定
1.3 统计分析
2 结果与分析
2.1 发芽种子的α-淀粉酶活性
2.2 α-淀粉酶活性的品种间分布与品种比较
2.3 大麦干种子的α-淀粉酶活性
2.4 测定年份和方法对α-淀粉酶活性的影响
3 讨论
3.1 中国大麦的α-淀粉酶活性
3.2 影响α-淀粉酶活性鉴定的因素
3.3 α-淀粉酶活性鉴定的适宜方法
3.4 α-淀粉酶活性鉴定的最佳时间
4 结论
附录
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