计算机化学实践基础教程

　　计算机化学是以计算机为技术手段，建立化学化工信息资源化和智能化处理的一套理论和方法。《计算机化学实践基础教程》针对学生在计算机化学学习及研究过程中可能会遇到的各种问题，以直观的图文注解方式进行讲解，并穿插操作技巧和方法。《计算机化学实践基础教程》包括化学信息库、化学分子结构绘制、Linux基础知识、计算机化学模拟、数据处理及作图、Perl程序编写等内容。每一章均自成体系，可单独阅读。《计算机化学实践基础教程》最后给出一个计算机化学科学研究实例，总结了各个章节在该实例中的应用。《计算机化学实践基础教程》可作为高等院校的化学信息学、生物物理学及其他相关专业教材，也可作为相关领域研究人员的入门教材，对信息处理人员也有一定的参考作用。

　　胡建平，1978年生，博士，教授，湖南永州人。1999年毕业于吉林大学生命科学学院生物制药专业；2008年毕业干北京工业大学生命科学与生物工程学院生物医学工程专业，获得北京工业大学优秀博士学位论文奖。从2000年至今，一直从事生物大分子结构及动力学的计算机模拟和分子设计研究。目前主要致力于蛋白质一配体的相互作用与复合物结构预测、蛋白质折叠机理与功能研究，以及计算机辅助药物设计与筛选等方面的研究工作。在国内外期刊及会议上发表学术论文60余篇，SCI检索30余篇。主持2项国家自然科学基金、2项教育部等省部级基金和4项教育厅等市厅级基金。目前是中国生物物理学会会员，四川省“生物有机化学与表面科学重点实验室”主要成员，乐山师范学院校级研究机构“分子设计中心”主任。

前言
第一章  化学信息学网络资源
  第一节  化学信息学数据库
  第二节  电子图书阅读工具——Adobe Acrobat
  第三节  蛋白质结构数据库
  第四节  文献数据库——Web of Science
  参考文献
第二章  分子结构绘制及显示
  第一节  小分子结构绘制及创建——ChemDraw
  第二节  小分子结构显示——Chem3D
  第三节  生物大分子结构显示——VMD
  第四节  生物大分子结构显示——Spdbv
  参考文献
第三章  Linux基础
  第一节  Linux简介
  第二节  文件操作命令
  第三节  目录操作及联机帮助命令
  第四节  进程及其管理
  第五节  文本编辑
  参考文献
第四章  分子模拟
  第一节  分子对接——AutoDock
  第二节  分子动力学模拟——AMBER
  第三节  量子化学计算——Gaussian
  参考文献
第五章  数据传输
  第一节  常规下载——FlashGet
  第二节  数据上传——CuteFTP
  第三节  远程连接——Xmanager
  参考文献
第六章  数据分析与绘图
  第一节  数据分析——Excel
  第二节  数据绘图——Origin
  第三节  统计软件——SPSS
  参考文献
第七章  图像处理
  第一节  简单绘图——画图附件
  第二节  图像编辑——Photoshop
  第三节  图像绘制——CorelDraw
  参考文献
第八章  计算机应用基础
  第一节  文本编辑——Word
  第二节  文本列操作——UltraEdit
  第三节  流程图绘制——Visio
  第四节  演示文稿制作——PowerPoint
  参考文献
第九章  Perl语言初步
  第一节  Perl安装及启动
  第二节  Perl的基本语法
  第三节  Perl的使用实例
  参考文献
第十章  HIV-1整合酶与L708，906抑制剂结合模式及运动性的研究
  第一节  计算方法
  第二节  结果与讨论
  第三节  与《计算机化学实践基础教程》的关联
  参考文献
附录