蛋白质结构与功能入门

　　《蛋白质结构与功能入门》是Gregory A.Petsko和Dagmar Ringe编写的Proteins Structure and Function的中文翻译版。全书由五章组成，第一章主要介绍蛋白质各个结构层次上的基本知识，按照一级结构到四级结构的顺序讲述；第二章讲述蛋白质行使功能的结构基础，包括配体结合位点、活性位点行使功能的结构与功能机制；第三章则具体介绍了各种调控蛋白质功能的机制，包括蛋白质磷酸化、糖基化、甲基化、乙酰化、脂质化等各种修饰和蛋白质降解等对蛋白质功能的调控；第四章着重介绍如何利用各种生物信息学手段从序列推测功能，并举例说明如何对一个未知功能的蛋白质展开研究；第五章简要介绍解析蛋白质三维结构的技术，包括X射线晶体衍射法和核磁共振法。《蛋白质结构与功能入门》为从事蛋白质结构与功能研究和教学的教师以及研究人员提供参考，同时还可作为研究生和高年级本科生的学习用书。

暂缺《蛋白质结构与功能入门》作者简介

译者序
前言
本书使用说明
从序列到结果
第一章 从序列到结构
1-0 概述：蛋白质的功能和构造
1-1 氨基酸
1-2 基因和蛋白质
1-3 肽键
1-4 稳定折叠蛋白质的键
1-5 二级结构的重要性和决定因素
1-6 α螺旋的特征
1-7 β折叠的特征
1-8 二级结构的预测
1-9 折叠
1-10 三级结构
1-11 膜蛋白的结构
1-12 蛋白质稳定性：弱相互作用和柔韧性
1-13 蛋白质稳定性：翻译后修饰
1-14 蛋白质的域
1-15 蛋白质结构通则
1-16 蛋白质基序
1-17 α域和8域
1-18 α/β、α＋β和交联域
1-19 四级结构：一般原则
1-20 四级结构：分子间界面
1-2l 四级结构：几何学
1-22 蛋白质的柔韧性
第二章 从结构到功能
2-0 概述：蛋白质功能的结构基础
2-1 识别、互补和活性位点
2-2 柔韧性和蛋白质功能
2-3 结合位点的位置
2-4 结合位点的性质
2-5 结构蛋白的功能特性
2-6 催化：概述
2-7 活性位点的几何学
2-8 邻近性和基态去稳定
2-9 稳定过渡态和排斥水
2-10 氧还反应
2-11 加成/消除、水解和脱羧
2-12 活性位点的化学
2-13 辅助因子
2-14 多步反应
2-15 多功能酶
2-16 具有通道的多功能酶
第三章 蛋白质功能的调控
3-0 概述：调节的机制
3-1 蛋白质相互作用域
3-2 定位调节
3-3 pH和氧化还原环境对蛋白质功能的调控
3-4 效应物配体：竞争性结合与协同效应
3-5 效应物配体：构象变化与别构效应
3-6 基于核苷酸水解反应的蛋白质开关
3-7 GTP酶开关：小信号G蛋白
3-8 GTP酶开关：异源三聚体G蛋白酶转导的信号
3-9 GTP酶开关：蛋白质合成
3-10 马达蛋白开关
3-11 受降解作用的调节
3-12 蛋白质功能的磷酸化调节
3-13 信号蛋白质激酶的调节：激活机制
3-14 信号蛋白质激酶的调节：Cdk的激活
3-15 细菌的双组分信号转导系统
3-16 蛋白酶水解的调控作用：蛋白质前体的激活
3-17 蛋白质剪接：通过内蛋白子自身酶解
3-18 糖基化
3-19 脂质修饰介导的蛋白质靶向
3-20 甲基化、N-乙酰化、SUMO化和亚硝基化
第四章 从顺序到功能：结构和功能基因组学中的案例分析
4-0 概述：在基因组学的时代背景下从顺序到功能
4-1 序列对位排列和比较
4-2 蛋白质特征集
4-3 从顺序推测功能
4-4 研究蛋白质功能的实验手段
4-5 趋异进化和趋同进化
4-6 从顺序到结构：同源模建
4-7 从顺序到结构：Profile-based threading方法和“Rosetta”
4-8 从结构预测功能：蛋白质超家族
4-9 确定结合位点的策略
4-10 确定催化残基的策略
4-11 TIM桶：一种结构，多种功能
4-12 PLP酶：多种功能，一种结构
4-13 兼职：多功能蛋白质
4-14 变色龙序列：一条序列，多种折叠方式
4-15 朊病毒、淀粉状蛋白和丝氨酸蛋白酶抑制剂：亚稳定的蛋白质折叠
4-16 从未研究过的基因的功能：半乳糖酸脱水酶
4-17 从零开始：一个功能未知的基因产物
第五章 结构测定
5-1 结构信息的解读
5-2 利用X射线晶体分析法和NMR法进行结构测定
5-3 晶体和NMR结构的质量及表述
参考文献
定义
索引