计算化学：从理论化学到分子模拟

　　计算化学是近年来飞速发展的一门学科，它主要以分子模拟为工具实现各种核心化学问题的计算，架起了理论化学和实验化学之间的桥梁。本书在一个比较严格的理论框架中介绍了计算化学。全书分两部分：基本原理篇和应用篇，共11章。基本原理篇（第1-6章）包括：体系的经典力学描述，势能面，分子动力学方法，Monte Carlo模拟，相关函数和近平衡态的量子统计理论；应用篇（第7-11章）包括：热化学，输运性质，分子光谱的模拟，固体材料和统计数学在药物、材料设计上的应用。本书尽量介绍具有物理意义的方法，不得已才采用单纯的数学模型。为了方便阅读，本书备有附录用来介绍重要的数学工具。本书可作为化学、物理、材料科学、药学、生命科学等有关专业领域高校教师、科研人员的参考书和研究生教材。

暂缺《计算化学：从理论化学到分子模拟》作者简介

序
前言
符号说明
绪言
参考文献
基本原理篇
　第1章 体系的经典力学描述
　 1.1 基本概念
　 1.2 经典力学
　　　1.2.1 最小作用量原理和Lagrange方程
　　　1.2.2 Hamilton E则方程
　　　1.2.3 最小作用量原理与：Hamilton正则方程
　　　1.2.4 Hamilton—Jacobi方程
参考文献
　第2章 势能面
　 2.1 Hohenberg-Kohn第一定理
　 2.2 分子结构文件表达方法
　　　2.2.1 直角坐标表达法
　　　2.2.2 内坐标法
　 2.3 势能面及其特征
　 2.4 力场方法
　　　2.4.1 力场方法的势能表达形式
　　　2.4.2 力场方法的本质和改进
　 2.5 能量极小化
　　　2.5.1 单纯形法
　　　2.5.2 最速下降法
　　　2.5.3 共轭梯度法
　　　2.5.4 Newton-Raphson法
　2.6 寻找过渡态
　　　2.6.1 过渡态附近的势能面特征
　　　2.6.2 势能梯度的模方
参考文献
　第3章 分子动力学方法
　 3.1　初等分子动力学原理
　　　3.1.1　Verlet法
　　　3.1.2　蛙跳法
　　　3.1.3　速度Verlet法
　　　3.1.4　位置Verlet法
　　　3.1.5　Beeman法
　　　3.1.6　Gear法.
　3.2　随机动力学模拟
　　　3 2.1 Langovin方程及其形式解
　　　3.2.2　随机动力学中的蛙跳法
　3.3　限制性和约束性分子动力学模拟
　　　3.3.1　限制性分子动力学模拟.
　　　3.3.2　约束性分子动力学模拟——SHAKE法
　3.4　恒压体系的模拟
　　　3.4.1　标度变换恒压法
　　　3.4.2 (NpH)系综的恒压扩展法(Andersen法）
　　　3.4.3 晶胞可变的(NpH)系综的模拟——Parrinello-Rahman法
　3.5　恒温体系的模拟
　　　3.5.1 Woodcock变标度恒温法
　　　3.5.2 Berendsen变标度恒温法.
　　　3.5.3 Andersen热浴法
　　　3.5.4　恒温扩展法——Nose动力学
　　　3.5.5　Hoover动力学
　3.6　经典力学及其算符方法
　　　3.6.1　概率密度分布函数、Liouville方程
　　　3.6.2　经典Liouville算符、力学量的时间演化
　　　3.6.3　经典演化算符、时间反演对称性
　　　3.6.4　Trotter定理和经典演化算符的因子化
　 3.7　多重时间尺度积分的分子动力学模拟
　 3.8　Hamilton体系的辛算法
　　　3.8.1　Hamilton力学的辛结构.
　　　3.8.2　正则变换的辛结构.
　　　3.8.3　线性Hamilton体系
　　　3.8.4 线性Hamilton体系的基于Pade逼近的辛格式
　　　3.8.5　非线性Hamilton体系的Euler中点辛格式
　　　3.8.6　辛算法实例
　3.9　Poincae回归定理与分子动力学模拟
　　　3.9.1　Poincare回归定理
　　……
　第4章 Monte Carlo模拟
　第5章 相关函数
　第6章 近平衡态的量子统计理论
应用篇
　第7章 热化学
　第8章 输运性质
　第9章 分子光谱的模拟
　第10章 固体材料
　第11章 统计数学在药物、材料设计上的应用
附录
索引