生物信息学中的智能计算理论与方法研究

　　本书编选了2006年中国科学院“智能计算与生物信息学”学术研讨会的40篇论文。内容涉及智能计算与生物信息学各主要领域，包括蛋白质结构与相互作用（9篇）、基因测定与算法设计（12篇）、序列分析与结构比对（3篇）、生物数据库的开发、管理与搜索策略（4篇）、智能计算在生物信息学领域的应用研究（8篇）及其他（4篇）等。.本书反映了近几年国内和国外智能计算与生物信息学领域的部分最新研究成果，基本代表了目前智能计算与生物信息学技术的发展状况，具有较高的学术价值。..本书适合相关领域的科技人员和大专院校师生参考。...

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第一部分 蛋白质结构与相互作用
Structural Modelling of the Saccharomyces Cerevisiae and Candida Albicans PEPCKs：Models
for the Antifungal Drug Design
计算机模拟短小芽孢杆菌木聚糖酶与底物木聚糖的对接
数据挖掘在蛋白质二级结构建模中的应用研究
一种基于最小自由能和协变信息预测带伪结RNA二级结构的迭代化方法
Effective Protein Folding Prediction Based on Genetic-Annealing Algorithm in Toy Model
3D Structural Motif Finding in Protein Strutures by Network Alignment
RelBay：A Combined Method for Mining Literature of Protein Phosphorylation Sites
Prediction of Enzyme Catalytic Residues Based on Naive Bayes Classification
蛋白质折叠速率计算
第二部分 基因测定与算法设计
Mining Data of Global Gene Expression in Human Skeletal Muscle Relate to Regular
Aerobic Exercise by BRB-ArrayToolsKe Jiebing，Ma Wenli，Lin Jiandi，Jiang Li，Zheng Wenling
酵母基因上游中二聚体寡核苷酸转录调控位点的分析
基于基因表达谱的肿瘤分类研究进展
基于大规模DNA微阵列数据的调控亚网络的重建
基于模糊关联规则的聚类算法在基因表达数据分析中的研究
基于序列特征的戊肝病毒基因分型方法
细菌基因组水平转移基因预测
Quantitative Analysis of Gene Regulatory Networks in Response to V~ous Environmental Stresses
调控元件和组合元件的识别以及全基因组分布分析
Hybrid Intelligent Data Mining Techniques and Array CGH in Breast Cancer Profiling
Hlippo Menolascina，Stefania Tommasi，Vita Fedele，Angelo Paradiso，Giuseppe Mastronardi，Vitoantonio Bevilacqua
基于基因芯片表达谱的癌症预后元分析研究
针对早期应答基因的专用检测芯片设计
第三部分 序列分析与结构比对
一种快速的序列次序无关的结构比对方法
ANew Method for Pairwise Protein Structure Alignment
Genome—wide Comparative Phylogenetic Analysis of SBP—box Gene Family in Arabidopsis and Rice
第四部分 生物数据库的开发、管理与搜索策略
生物序列数据库管理系统研究
基于Web的基因表达数据管理系统的设计与实现
疾病相关SNP数据的分类组织及数据库构建
MoBIoS Index：Support Distance-Based Queries in Bioinformatics
第五部分 智能计算在生物信息学领域的应用研究
SAT问题的主要算法模型
拟位生物信息学分析工具
ANew Method for Conversion from Torsion Space to Cartesian Space
Thirty-four Pseudoknots of Twenty-two Human C2H2 Zinc Finger ESTs Discovered
by Computational Structural Analysis
An Adaptive Elastic Registration of Two-Dimensional Electrophoresis Gel Images
Using Intensity Information and Landmark Points
具有灾变效应的合作式协同进化遗传算法
Data Model of Knowledge Base of Reproductive Biology
Effect of Decay Functions in Medical Diagnoses with GRLS Neural Networks
第六部分 其他
Bc1，2家族蛋白调控线粒体外膜通透性的细胞自动机模拟
The Relationship Between Molecular Motions of HIV-1 gpl20 Mutants and Their Preferences
for Different Conformations
Neighboring Nucleotide Biases of the Intra-Varietal Single Nucleotide Polymorphisms
of the rice Plastid Genome
基于MATLAB的分子系统学研究——以鳄类分子系统学研究为例