基于WWW的生物信息学应用指南

　　在当今的信息时代，失去信息的利用，等于失去许多重要的一切。《基于WWW的生物信息学应用指南》则是教会从事生物、医学等生命科学的人们如何利用国际互联网掌握更多、更前卫的生物信息。环球网（WWW）是当前国际互联网中重要的信息网，它涵盖核苷酸和蛋白质序列查询、递交、基因的计算机克隆、序列相似性搜索，蛋白质基序和结构域识别、进化树构建、蛋白三维同源模型构建以及基因数字化差异表达分析等主流生物信息学的应用，以上内容在本书中均作了详细阐述。同时，《基于WWW的生物信息学应用指南》最大的特色是结合了中南大学肿瘤研究所以及肿瘤基因组研究中心精心设计了多达43个具体生物信息学应用练习题，并按实例进行深入浅出的表达，讲解清晰，使读者能够直接参考这些练习来解决科研中的实际问题，避免不必要的重复研究，少走弯路，有助于提高我国生物科学研究水平。本书很适合从事生物学、医学、分子生物学、肿瘤学、病理生理学等专业的科研人员及工作者阅读参考，也可作为本科、研究生教育教材使用。

暂缺《基于WWW的生物信息学应用指南》作者简介

第1章 引论
1.1 基因组／蛋白质组信息学
1.1.1 基因组信息学
1.1.2 蛋白质组信息学
1.2 互联网与生物信息学
1.2.1 互联网基础
1.2.2 生物信息学数据库
1.2.3 生物信息学软件
1.3 生物信息学门户网站
1.3.1 美国国立生物技术信息中心
1.3.2 欧洲生物信息研究所
1.3.3 瑞士蛋白质分析专家系统
1.3.4 北京大学生物信息中心
第2章 序列查询和递交
2.1 Entrez查询系统
2.1.1 简介
2.1.2 Entrez系统的基本查询功能
2.1.3 查询策略
2.2 LocusLink查询系统
2.3 SRS查询系统
2.4 序列信息递交
第3章 序列相似性搜索
3.1 概述
3.1.1 序列相似性与同源性
3.1.2 全局和局部序列比对
3.1.3 比对分数矩阵和空位罚分
3.1.4 比对算法
3.1.5 比对分数的统计学评价
3.2 序列相似性搜索
3.2.1 BLAST
3.2.2 Fasta
第4章 基因识别
4.1 基因组外显子预测
4.1.1 从头预测
4.1.2 相似性比较预测
4.2 基于EST的基因鉴定
第5章 多序列比对
5.1 ClustaIW
5.2 BOXSHADE
第6章 蛋白质基序和结构域识别
6.1 PROSITE patterns和PROSITE profile
6.2 Pfam和Prodom
6.3 SMART
6.4 Blocks和PRINTS
6.5 InterPro
第7章 进化树构建
7.1 PHYLIP软件包
7.2 ClustaIW程序
第8章 蛋白三维同源模型构建
第9章 基因数字化差异表达分析
第10章 核苷酸序列的一般分析
10.1 序列格式转换
10.2 互补和反向序列的转换
10.3 核苷酸序列统计
10.4 序列注释
10.5 序列翻译与ORF预测
10.5.1 EBI的Transeq
10.5.2 ExPASy的Translatetool
10.5.3 0RF识别
10.6 限制性酶切分析
10.7 质粒作图
10.8 引物设计
10.8.1 通用引物在线设计程序Primer3
10.8.2 简并引物在线设计程序GeneFisher
第11章 蛋白序列的其他特征分析
11.1 氨基酸基本理化特性分析
11.2 蛋白的亚细胞定位
11.3 膜蛋白跨膜区预测
11.4 蛋白序列二级结构预测
11.4.1 JPred预测服务器
11.4.2 PredictProtein预测服务器
第12章 整合的序列分析
第13间 蛋白质组信息学