一个名叫本的美国男孩成了马小跳班上的插班生。因为是马小跳的好朋友，本理所当然地跟唐飞、张达和毛超也成了好朋友，他还给自己取了一个中国名字叫“牛皮”。牛皮在许多方面都能跟马小跳他们打成一片，包括吃麻辣火锅，可就是看女孩子的眼光不一样，比如安琪儿在马小跳他们眼里，是个又丑又笨的女孩，在牛皮的眼里，却是个又美丽又有趣的女孩。在一次雪崩的遭遇中，牛皮与马小跳他们的友情，经历了生死的考验。

马小跳的奶奶家所在的望龙山发生大地震了，马小跳在那里的小伙伴小非洲在学校坍塌的危急关头，舍己救人，当上了小英雄，还上了电视、登了报纸呢！这场大地震不仅让小非洲失去了右手和右脚，还让他失去了上学的学校。在马小跳的强烈要求下，小非洲住进了马小跳的家，跟马小跳做了同班同学，还做了同桌。他们和夏林果一起，帮助一个热爱跳芭蕾舞、但在大地震中失去一条腿的女孩，走出抑郁的阴影，在舞台上实现了她的芭蕾梦，成为光彩照人的芭蕾公主。

暑假期间，马小跳和唐飞跟随唐飞的舅舅，一个研究熊猫的博士、还有一个专门拍摄野生动物的美国摄影家和他的女儿，一起来到藏龙山熊猫自然保护区，寻找野生大熊猫。在寻找的过程中，马小跳和唐飞不仅学到了很多关于野生动物的知识，还悟出了人和动物相互依存的和谐关系。因为大熊猫是世界的珍稀动物，在抢救一只生病的大熊猫的历险中，马小跳亲眼目睹一些利欲熏心的人犯下的种种罪恶。

马小跳班上的女同学、安琪儿的好朋友黄菊，她是农民工的孩子。在一个夜晚，黄菊的爸爸出车祸了，撞伤黄菊爸爸的司机却逃逸了。侠肝义胆的马小跳发誓要找到肇事司机，让他承担法律责任。他召集唐飞、张达和毛超成立了一个“侦探小组”，到处寻找车祸的目击证人。在侦查的过程中，有一个叫老杜的中年男人热心地加入到“侦探小组”里来，他为黄菊的爸爸支付了全部的医疗费用，还从千里之外找回了黄菊的妈妈。“侦探小组”终于破案了，找到了撞伤黄菊爸爸的肇事司机，他是谁？

杜真子是马小跳的表妹，这是一个外表泼辣、内心孤独的女孩，她心灵手巧，特别喜欢厨艺，会做土豆沙拉，她身上似乎有一种魔力，能把男生们指挥得团团转。马小跳的那几个好朋友都很崇拜她，马小跳有些怕她，因为她有一只心爱的猫，这只猫会用各种各样的笑，来表达自己的感情。看见马小跳与杜真子发生争吵，这只会笑的猫便会对马小跳冷笑，令马小跳毛骨悚然……

马小跳有三个形影不离的铁哥儿们，一个是嘴巴大得像河马的张达，他说话结巴，吵架会输，打架会赢，是个体育全才，还爱跟汽车赛跑；一个是挺着肚子走路像企鹅的唐飞，他贪吃，整日懒洋洋的，头脑却像他当董事长的爸爸一样精明；一个是说是箩筐话、有箩筐都是废话、样子长得像猿猴的毛超。他们调皮捣蛋，经常做一些让秦老师生气的事，马小跳也经常遭遇他们的背叛。但面对坏人坏事，他们却能团结一心，都成了见义勇为的小英雄。

唐飞得到一件生日礼物摄像机，他们几个好朋友玩起了以马小跳的名字命名的“跳跳电视台”。谁也没想到，他们在野生动物园拍摄的两个DV作品会在真正的电视台连续两个晚上被播放出来。但是，他们拍摄的关于“儿童电影”的访谈节目却被电视台“枪毙”了。雪上加霜的是，秦老师要让路曼曼取代马小跳当“跳跳电视台”的台长，唐飞要和马小跳决裂……

马小跳要去竞选模拟城市的超级市长，神童林子聪觉得“这本是凤凰的游戏，鸡却跑来搅和”；小大人丁文涛则认为“如果一定要把大象和蚂蚁放到一起，大象只会踩死蚂蚁”，但马小跳的铁哥儿们唐飞、张达和毛超却力挺马小跳，他们同心协力，帮马小跳一路过关斩将，马小跳终于如愿以偿，不仅当上了超级市长，还代表全市的孩子在电视上跟真正的市长进行了平等的对话。

马小跳最想跟夏林果同桌，不是因为夏林果漂亮，而是因为她是学校的大队长，只管学校的大事，不会去管马小跳的闲事。还因为夏林果从小练芭蕾舞，眼睛永远盯着前方，不会盯着马小跳在干什么。让马小跳对她产生特别好感的是，是她的善解人意，她是真正懂马小跳的，包括他的一些奇怪的想法和做法。就是这样一个近乎完美的女孩，她也有嫉妒别人的时候，也有装模做样的时候。

马小跳有个像谜一样的舅舅，被称为“新新人类”。他四海为家，飘来飘去。他把头发染成五颜六色的，穿着有洞洞的空调裤，每天带着手提电脑去咖啡馆上班，喜欢看动画片，喜欢玩蹦极的游戏，平时漫不经心的他，有些事情却特别较真，他开车时不小心撞坏了路牌，就算没人看见，他也一定要赔偿。他还是个坚定的环保主义者，在一次去大山里的徒步旅行中，马小跳亲眼看见他一路捡着矿泉水瓶和白色的塑料袋，让喜欢他的马小跳对他又增添了几分崇敬之情。