E-mail访问网络生物医学资源实用指南

　　本书是一本介绍如何通过E-mail获取Internet上医学和生物学信息资源的基本原理和方法的工具书。包括的内容有：检索Medline：蛋白质、核酸与三维结构数据库；检索分析与人类基因组研究相关的一些重要的网络数据库，如序列的同源性、开放阅读框架（ORF）预测、蛋白质二级结构分析、RNA二级结构预测、分子模建等，这些都是生命科学最前沿的研究热点。现代科学研究的一个显著特点就是综合性大研究，学科之间交叉、联系日益紧密。本书介绍了如何通过Internet上邮件列表和新闻组这两种形式在世界范围内与同行或非同行交流、联系、协作、探讨；如何访问WWW上的医学生物学资源和WWW的各类检索引擎；如何访问FTP资源，寻找和下载有用的一些生物学档案资料；附录介绍一些使用E-mail技巧，使各章介绍的方法事半功倍。本书的主要读者对象为医学、药学和生命科学等领域的大学生、研究生、医务工作者、教师和研究人员。

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绪论
第一章 Medline——蛋白质、核酸与三维结构数据库检索
第一节 简介
第二节 Entrez可检索的数据库
第三节 词条检索
一 字段说明符
二 字段解释
三 布尔检索
四 截词检索
五 范围检索
第四节 搜索参数选项
一 显示方式选项
二 其他选项
第五节 替代符号
第六节 流水号检索
一 GenBank登录号与序列标识符
二 用于UID中的Fasta格式
第二章 基因和基因组序列分析
第一节 NCBI BLAST电子邮件服务器的介绍
一 访问NCBI BLAST电子邮件服务器
二 BLAST电子邮件检索请求示例
三 NCBI BLAST电子邮件服务器检索的可选程序
四 NCBI BLAST电子邮件服务器可用数据库
五 NCBI BLAST电子邮件服务器指令表
六 利用NCBI BLAST电子邮件服务器检索的序列格式
七 序列标识符
八 检索请求的呈递与等候
九 向GenBank呈递新的数据或更新修订
第二节 BLAST程序使用详解
一 BLAST程序算法
二 BLAST序列对比分值方案
三 邻域
四 HSP分值阈
五 Karlin-Altschul统计学
六 SUM统计学和Poisson统计学
七 P值、比对分值及信息
八 匹配报告中的选择度
九 搜索敏感度
十 遗传代码
十一 设置参数
十二 控制输出
十三 环境变量
十四 支持功能
十五 输出示例与详解
十六 原因不明的故障
第三节 BLAST常见问题解答
一 最常见的问题
二 BLAST程序
三 查询格式
……
第三章 访问医学与生物学邮件列表
第四章 访问医学与生物学新闻组
第五章 访问医学与生物学WWW资源
第六章 通过E-maill访问WWW的各类检索引擎
第七章 访问医学与生物学FTP资源
附录 一些实用的 E-mail技巧