虽然理论充分，三条实美的态度也发生了动摇，但西乡仍固执己见，并利用自己在军界的巨大影响力，强迫同僚接受征韩论。激烈的争论中，三条实美“病”倒了。西乡仍不屈不挠地坚持急征朝鲜。双方暂时呈僵持局面。
10月19日，经宫廷政治的运作，由天皇宣布岩仓代因“病”递交辞呈的三条实美主政，并指示：“整理国政，培养民力，以期成功于永远。”这才打破了力量平衡。
这里值得指出的是，三条和岩仓虽然都是缓征派的支持者，但是，前者意志不够坚强，难以对抗咄咄逼人的西乡隆盛。而岩仓则不然，西乡隆盛跑到他家中大吵大叫，岩仓也不为所动，而是还以大吵大叫。他和大久保互相支持，终于将西乡一派压制了下去。这就是日本史中所谓的“十月政变”。
10月23日，西乡隆盛辞去所有职务。带了一名随从、一名仆役，身披蓑衣，手拿猎枪，一副当代源义经的姿态离开了东京，先是到木下川越后屋的别墅，吟诗作赋、临池垂钓了三天，接着便回了鹿儿岛。他于明治七年六月设立私人学校，麾下聚集了15000人的私人武装，成为当时日本国内一支极其特殊的力量。
对当时的日本政坛而言，西乡的辞职带来了很大的震荡。就在他引退的第二天（24日），作为核心追随者的板垣、江藤，还有刚从中国返回的福岛也递交了辞呈并被批准。其中福岛放弃了他一直参与的征台之议，转而支持征韩。同为陆军少将的桐野利秋与蓧原国干也跟着辞职，并追随西乡去了鹿儿岛。村田新八则从欧洲赶回递交了辞呈。闹到最后，每天都有数百名萨摩与土佐藩出身的军官纷纷或称病辞职或请求除名，然后络绎西行，像朝圣一样投奔西乡隆盛。桐野利秋甚至决定组织一场针对岩仓具视等要员的暗杀活动，只是因为遭到西乡的严厉斥责，才没有立即付诸实施。但是，后来（明治七年一月）还是发生了岩仓遭刺事件，虽然岩仓命大，身中数刀而未死，但已经隐约可见后来日本少壮激进派的身影。
回头再看台湾的桦山资纪。他结束台南考察后，于12月6日离开台湾赴香港，再到上海。这才得知国内已经暂时放弃了征韩论，内治派占上风，西乡隆盛等要员下野。虽然西乡从道给桦山来信并捎带口信，希望他能“暂时回国”，可桦山还是决定不回日本，而是再赴台湾。正如他在日记中所写下的那样，此时的桦山虽然对当局的决策深感惋惜，但却绝不会就此罢手，他认为：“好不容易在台湾经营可以就绪之际，却发生了几近绝望之感的情事。然而余等之目的与决心绝不会因此而沮丧，反倒是愈益强势地达成目标。”他先是在上海和陆军派往中国的益满邦介、美代清元等七名侦察员接上了头，于12月26日乘坐日本军舰“春日”号（舰长井上馨）离开上海，经香港、广东、澳门、汕头，一路搜罗情报，最后在1874年的3月2日抵达澎湖，3月9日登陆打狗，开始对台湾南部地区作更详细的考察。
让桦山喜出望外的是，在4月22日，他与水野遵在淡水意外遇到了久不相见的儿玉利国，还有陆军中尉田中纲常、中尉池田德四郎及成富清风等人。原来，这帮人准备以怀柔原住民的方式，策动台东的奇莱平原“独立”，然后展开日本殖民活动，将之建设成一个基地，并伺机占领整个南澳平原。
对于这个行动，桦山不用说是非常支持，但双方虽约定一起行动，可很快他们就又分道扬镳了，因为日本国内的政局又发生了出人意料的大逆转。
