赤壁之疫
据《三国志·吴书》所载，赤壁之战，曹操不认输，他不承认败于周瑜，声称只是由于疫症折损战力，才烧船撤兵。这说法也有史实依据，《后汉书》的《孝桓帝纪》及《孝灵帝纪》载，由公元151年至182年，32年间的正月至三月，至少有七次“大疫”。
赤壁之战发生于公元208年，据《后汉书》、《三国志》及有关文献记载，建安十三年至司马炎灭吴（公元208年至280年）这73年间，“大疫”频繁，“疫气”、“暴疾”（周瑜死因）、“疫旱并行”、“疾疫”、“疫疠”、“疠气”，俱为当时流行病的不同名称。
史家按现代病理学研判，“大疫”可能是急性血吸虫病、疟疾或斑疹伤寒，疫症历时六十多年，遍及各地，也有可能不限于一种，而是数种交替爆发。李友松的《曹操兵败赤壁与血吸虫病关系之探讨》指出，曹操赤壁兵败，乃血吸虫病严重流行之时，马王堆西汉墓女尸体内，也有血吸虫虫卵。赤壁战场为血吸虫病流行区，但时值寒冬，并非急性血吸虫病的流行季节。
疟疾流行于长江流域，传播季节是四月至十月，曹军劳师远征，极有可能在征途上染病而在军中传播，晋代葛洪著有《肘后备急方》，其中“治寒热诸疟方”即专治疟疾。斑疹伤寒也是当时流行的传染病，东汉名医张仲景的《伤寒杂病论·序》载，建安以来十年左右，其族二百多人有三分之二病死，患者身上“斑斑如锦纹”，那是斑疹伤寒。
战争与疫疠
斑疹伤寒流行于战争及饥荒时期，多发病于寒冷地区的冬春季节——那正是赤壁之战的时空背景。《三国志》称流行病为“疫疠”，此病的专门研究可远溯至隋代，隋太医巢元方著有《诸病源候总论》，其中“疫疠病诸候·疫疠病候”说：“其病与时气、温、热等病相类。皆由一岁之内，节气不和，寒暑乖候，或有暴风疾雨，雾露不散，则民多疾疫病，无长少率皆相似，如有鬼厉之气，故云疫疠病。”疫疠是否跟疟疾相关，那就无从稽考了。
曹植《说疫气》对疫疠有详尽描述：“建安二十二年，疠气流行，家家有僵尸之痛，室室有号泣之哀。或阖门而殪，或覆族而丧。或以为疫者鬼神所作”，又说患者多是“荆室蓬户之人”，鲜有“鼎食之家”，曹植认为“此乃阴阳失位，寒暑错时，是故生疫。而愚民悬符厌之，亦可笑也”。那是说，疫疠乃“阴阳失位，寒暑错时”所引发的平民流行病。
《后汉书·卢植传》载，尚书卢植奏曰：“御疠者，宋后家属，并以无辜委骸横尸，不得收葬，疫疠之来，皆由于此。宜敕收拾，以安游魂。”那是说，疫疠流行，皆因“委骸横尸，不得收葬”，那么，为何“不得收葬”？这跟连场战争有关，魏围江陵，吴伐琼崖、围新城，蜀征南中，战争频繁，正好应合“兵入民出，必生疾病”之说，形成了处处皆是“疫疠之乡”，染病而死的军民愈来愈多，真是尸横遍野，如何能够收葬？这就造成了数十年来战争与疫疠互为因果的局面。
