庄子的哲学主要接受并发展了老子的思想。他认为，“道”是超越时空的无限本体，它生于天地万物之间，而又无所不包，无所不在，表现在一切事物之中。然而它又是自然无为的，在本质上是虚无的。
在庄子的哲学中，“天”是与“人”相对立的两个概念，天代表着自然，人指的是人为的一切，与自然相背离的一切。“人为”两字合起来，就是一个“伪”字。庄子主张顺从天道，而摒弃“人为”，摒弃人性中那些“伪”的杂质，从而与天地相通。
在庄子看来，真正的生活是自然而然的，因此不需要刻意去规定什么，也不需要去进行政治宣传、礼乐教化、仁义劝导等一些伪的东西。在这种思想指导下，庄子反对儒家的以仁义治国和法家的以刑罚治国，与老子一样，主张无为治国，任其自然。君主要宽容无私，处事顺其自然，这样天下才能大治。
但是，在庄子的思想中，渐渐失去了老子思想中那种有为的精神，不再强调以“无为”作为手段，来达到“无不为”的目的，而是把无为、养生当成了目的。他把老子的辩证法发展为否定存在评判事物的客观标准的不可知论，把老子的无为发展为追求与世无争的自我存在的避世主义，其消极性是不言而喻的。
庄子的消极避世，自我放纵，再加上他浪漫主义的文笔，都促使人们对他形成某种神秘主义的印象，给后人留下更多想象的余地，后来流传有很多关于庄子的传说。
有一个传说，说庄子梦见自己成了蝴蝶，在百花丛中自由自在地飞翔，后来，他甚至弄不清楚，到底是庄周变成了蝴蝶，还是蝴蝶变成了庄周。唐代大诗人李商隐的《锦瑟》诗中有一句是 “庄生晓梦迷蝴蝶”，就是用的这个典故。
还有一个传说，仍旧是用庄子的妻子来作比喻，说庄子与他的妻子相约，他死后，坟土干了之后，他就可以改嫁。后来庄子假死，看他妻子的表现，可当他回来时，却见他的妻子正在用一把扇子扇他的坟。
庄子是老子之后道家学派最重要的代表，因此后世将他和老子合称“老庄”，道家的哲学也被称为“老庄哲学”。
在唐代，《老子》也称《道德经》，《庄子》也称《南华经》，《列子》也称《冲虚经》，《文子》也称《通玄经》，道家的四部著作，同时也被道教视为四大经典。唐王朝还曾设置博士、助教讲习这些经典，并将之列入唐代的科举教育体系。
