鲁迅后来曾对他的爱人许广平谈到这一点，说：“凡做领导的人，一须勇猛，而我看事情太仔细，一仔细，即多疑虑，不易勇往直前。二须不惜用牺牲，而我最不愿意使别人做牺牲（这其实还是革命以前的种种事情的刺激结果），也就不能有大局面。”
弘文学院毕业临近，大家面临学科的选择。
弘文学院的老师建议鲁迅等同学选择医学。他解释说，日本医学的水平经过多年的努力，已经相当高，可以与德国媲美，而且学校又很多，容易考取。当时，在留学生中，学习法政和军事的极多，此外学工的也不少，但学工的名额有限，要同日本学生竞争，中国学生没有优势。鲁迅和别的几位同学正是清政府派来学工科的，他们原定在弘文学院毕业后进帝国大学冶金科。
然而他们早就被告知，必须另觅出路。
医学倒是切近老百姓的日常生活。当医生救死扶伤，也是一个不错的行业。更何况，如果能从医学研究入手，推动其他学科的发达，使中国的改革事业加快步伐，倒是一件两全其美的事。
鲁迅想得更多。他一直以为，自己那30岁就病逝的父亲，纯粹是被庸陋的中医断送了生命。如果善意地说，那几位中医是无意的骗子，他们不懂人体构造，只用了祖传的方子试来试去，把本来并不难治的病耽误了。鲁迅自己则受到过西医的恩惠。原来他从小就有牙病，在家乡时也曾找医生治疗，但没什么效果。有个半通不通的医生用中医的一套阴阳循环论，严正地指出，他牙齿不好，是自己生活不检点所致。中医认为，牙齿与肾脏相通，如果肾脏不好，牙齿就受影响。言外之意，就是说鲁迅由于性生活过度伤了肾。这使鲁迅极为反感和恼怒。到日本后，他曾经到长崎治过一次牙病，日本医生的认真态度和高明的医术，给他留下很好的印象。
那么就决定学医罢。接下来的问题是，入哪个学校呢？
选择学医的其他几个同学留在东京的医学专门学校。鲁迅最终的选择使大家都感到吃惊：他要到偏远的仙台去。
仙台的医学专门学校里还没有过留学生。也因为这个原因，校方给予鲁迅特别优待，免收注册费和学费。
9月中旬的一个星期二，八点钟开课以前，鲁迅在学校总务科职员的带领下走进教室，被介绍给一年级的同学们。鲁迅给大家的第一印象，据后来有的同学回忆，鲁迅个子不高，长方脸，白白净净的，眉毛较浓，额角宽阔，特别是两眼，炯炯有光。他的性格看起来比较沉静，眉目间略显忧郁，举止有些腼腆、矜持，可以看出他是一个感觉灵敏又善于思考的人。
课程安排极为紧张，没有时间游玩。星期一和星期五是早上七点上课，其他几天是八点钟上课。上午一般是学组织学、化学、物理学和德语，下午两小时学解剖或别的课程。新生每周还要上三节体操，第二年上半年加一节生理课。
鲁迅对学校的课程设置感到很不适应。日复一日，从这个教室奔到那个教室，笔记抄了一本又一本，自己喜欢的书却没有时间去看。教学方法是死记硬背，脑子整天昏沉沉的。
他到仙台不久，收到任克任从东京寄来的林纾翻译的《黑奴吁天录》，原著为美国斯陀夫人的小说《汤姆叔叔的小屋》，描写美国黑人遭受种族歧视的苦难生活，引起读者的深切同情。小说在美国南北战争时期产生过很大的影响。
中国人看这部小说，对黑奴的悲惨遭遇真是感同身受，中国人不也是在受着奴役吗？究竟应该怎么办？林纾在译本序跋中就说：“……译是书，非巧于叙恶，以博阅者无端眼泪，特为奴之势逼及吾种，不能不为大众一号。”又说：“今当变政之始，而吾书适成，人人既蠲弃故纸，勤求新学，则吾书虽俚浅，亦足为振作志气、爱国保种之一助。”
林译本一出版，立即在中国留学生中传阅。鲁迅那时已经到仙台，在这个较偏僻的城市是买不到这种书的。收到书，急切读完后，思绪联翩，他在给朋友的信中写道：
