“炸弹大王”喻培伦在攻打督练公所的队伍中。他胸前挂着满满一筐炸弹，左手执号筒，右手持手枪，左右开弓，越战越勇。战至半夜，终因寡不敌众，全身多处受伤。在突围过程中，队伍被打散，喻培伦被巡警捕获，当即处死。攻往小北门的一路也遭遇了清军的围堵，经过一夜作战，死伤众多。最后，张鸣岐放火烧街，徐维扬率部突围时被清军捕获。
黄兴和方声洞一行行至双门底附近，与温带雄所率配合攻打水师行营的巡防营相遇。本来，温所率的巡防营应在大南门外守候，但温带雄听得城内杀声四起，便按捺不住冲进城来。进城时，守门清军问话，温带雄以火把自照，说：“城内革命党人起事，我等奉令进城平乱，快快开门，不得有误。”守门兵士不知有诈，便大开城门。温带雄的人马一拥而入，手执火把，向枪声密集的地方奔去。
也是事有不周，温带雄为了进城方便，并没有缠上白巾。遇到黄兴所部时，双方并不认识，于是，悲剧不可避免地发生了。
双方相遇时，革命军中的长枪短枪全都举了起来。温带雄高声喝问：“前边是什么人？”
方声洞不由分说就扣动了扳机，温带雄应声倒地，巡防营的官兵见状立刻还击，方声洞也倒地身死。这场自己人打自己人的激战真正把黄兴逼入了绝境。由于经历了大半夜的拼杀，革命党人的火力明显减弱，而巡防营却是长枪短枪齐发，子弹铺天盖地地一阵狂射，选锋们纷纷倒地。黄兴的嗓子已经嘶哑，他一边还击，一边示意大家撤退。
但事已至此，已经没有任何退路。即便是要赴汤蹈火也只有舍身而行了。多年来的严格训练，早已经让黄兴学会了控制情感，他不动声色地把生死置之度外，把百般的焦虑压在心底，选锋们在他脸上看到的，照旧是那一副难以猜度的冷静。
在强大火力的冲击下，选锋们很快就被冲散了，黄兴迅速检阅了一下自己的队伍，身边的人只剩下了二十余人，枪弹也即将告罄。这样一来，硬拼下去已经没有意义了。为了保存革命的力量，他当机立断，命令选锋队员们各自逃散，找地方避风，争取能逃出广州，潜回香港，以图再举。他自己则选择留下，尽可能地拖住清兵，掩护同志们撤退。志士们表示，要与黄先生共进退，杀身成仁。在黄兴的一再命令下，他们才借着夜色，钻小巷逃走。
在噼里啪啦的枪弹声中，黄兴又坚持了一会儿，听得枪声稀落了许多，便摸进了一条黑漆漆的小巷。小巷深处安静得出奇，一种撕心裂肺的疼痛感突然袭来，黄兴这才想起自己的手指已经受伤，再加上大半夜的奔袭，体力严重透支，黄兴双腿一软，倒在了一家住户的门前。定了定神，黄兴敲响了这家住户的房门。开门人手里提着一盏马灯，借着昏黄的灯光，黄兴依稀看见这是一个中年男人，脸上刻着长年劳作的印记。
黄兴在这个手工艺人狭窄简陋的家中躲避了几天，最终由同盟党人营救出城，潜往香港，总结教训，以期再战。
这次起义，除黄兴所部及顺德同盟会党按期行动外，其余各路都按兵不动。赵声及三百名党人因船期延误第二天才到达广州，胡毅生、陈炯明事先逃出了广州城，姚雨平也因为胡毅生的关系未能及时领到枪械，起义爆发时没有出战。这样，起义就成为黄兴一路的孤军作战。
几天之后，广州的同盟党人潘达微联络多处善堂，以防止疫情传播为由，经当局同意，收敛了死于街头及被杀于水师行台门外的选锋尸骸七十二具，葬于广州城外东北五里的黄花岗。
一道清洌的银河在天上徐徐铺开，泻进无边的夜空。秋虫在憧憧的暗影中悲鸣。没有风，黑暗深长的巷道里，树梢草叶凝然不动。很久以后，人们早就忘记了这次暴动，也忘记了那些义士的名字。耕牛晚归，稻菽翻浪的安详中，常有白鹭伴着晨风昏雨，温柔地降落在这片当年碧血横飞的土地上。
黄兴回到香港，广州起义的失败使他悲痛欲绝。他向孙中山报告了这次起义的过程，最后又悲愤地质疑：“这次起义是我们准备最充分、投入人力最多的一次，结果只经过几个小时就失败了，我们在其他地方还会成功吗？”
孙中山情绪一时也无比低落。但是他对大家说：“长期以来，我因遭受清政府通缉，无法进入国内和大家一起战斗，这次我在河内、香港指挥广州起义，清廷已要求英法当局及东南亚各国驱逐我出境，我不得已要去美国暂避一时。黄兴君尚未暴露，仍可留在香港观察国内的革命动向。革命形势看似低迷，但同志们决不能丧失信心。目前，宋教仁、蔡元培诸同志正在上海努力工作，长江流域各省的革命形势日益高涨，我并没有丧失信心，相信用不了两年，革命终将会在中华大地的某一个地方率先取得成功！”
无论如何，这一大批革命志士剑及履及，垂死的中国有了活气与光明。黄花岗起义一周年之后，孙中山先生为烈士们写下了这样的祭文：“寂寂黄花，离离宿草，出师未捷，埋恨千古。”过了十年，孙中山先生又在《黄花岗烈士事略》序言中写道：“……是役也，碧血横飞，浩气四塞，草木为之含悲，风云因之变色。全国久蛰之人心，乃大兴奋。怨愤所积，如怒涛排壑，不可遏抑，不半载而武昌大革命以成。”
