喻培伦、林文在黄兴的授意之下，分头去通知尚在广州的选锋和其他志士。黄兴立即给赵声发电：
母病稍痊，须购通草来。
这是预约的暗语，意思是要香港的敢死队员全部赶往广州，参加起义。
赵声接到黄兴的电报，已经是二十七日的晚上，但香港开往广州的轮船要到后天早上才有，怎么办？赵声只好发电报给黄兴，请求将起义时间延至二十九日。
黄兴同意了。
考虑到期间发生的那些周折，情况已经有了很大的变化，时间也很仓促，经过一番权衡，黄兴决定把原来的十路进攻改为四路进攻。第一路，由他亲自率领负责攻打总督衙门；第二路，由陈炯明带队负责攻打督练公所；第三路，由姚雨平带队负责攻打北门；第四路，由胡毅生带队负责扼守大南门，接应新军巡防营第三营入城。这四路中，第一路是决定起义成败的关键，所以黄兴决定把主要力量都投进去，并亲自指挥。起义的时间定在下午五点半。为了容易辨识，所有起义人员一律臂缠白毛巾作为标识。
马上就要参加起义了，黄兴和志士们心潮起伏，虽然早已经把生死置之度外，但在这样一个时刻，心中又涌起了无限的柔情，想对家中的亲人说些什么。他们纷纷动笔，写下一些文字，给父母妻子留下一点纪念。在众多的绝笔书中，林觉民的《与妻书》成了烛照后世的名篇。
公历4月27日下午5点多，起义的时间近了。黄兴注视着手中的怀表，那秒针滴滴答答地跳跃着，指针刚指向五点三十分，他就大喝一声，向天鸣枪，同时和选锋一百三十多人冲往总督署。
在总督署门口，黄兴和他的队伍遭到了督署卫队的负隅顽抗，革命军枪弹齐发，击毙卫队管带，冲入督署。但是，他们搜遍了总督署，也没见两广总督张鸣岐的人影。原来，在黄兴和革命党人在门口和卫兵激战的时候，张鸣岐听到门口动静不小，心知有异，忙从院墙一侧的小门溜跑了。
没抓到张鸣岐令人失望，只好捣了他的老巢。黄兴下令放火，前殿后院的总督署衙门顿时火光冲天。
黄兴和众选锋从总督署杀将出来，准备去攻打督练公所和弹药库，夺取尽可能多的枪支弹药，留待明天早晨从香港赶来的大批选锋队员使用。
黄兴他们刚走到莲塘街口，就与清军水师提督李准调来的亲兵大队发生了遭遇战。林文早就听说李准的手下有不少汉人，天性率真的林文挺身而出，向对方高喊：“共除异族，恢复汉疆！”然而，迎接他的却是一枚无情的子弹。子弹正中脑门，脑浆迸出，林文当场牺牲。其他几个选锋也相继中弹。林觉民的腰部中弹，当即扑倒在地，随后又扶着墙根挣扎着站起来，举枪还击，终于力竭不支，慢慢瘫了下去。清军一拥而上，抓住了林觉民。
战斗异常激烈，突然，黄兴感到右手一阵钻心的疼痛，他意识到自己一定是中弹受伤了，但他强忍着，也顾不上检查自己的伤情，继续射击。后来才知道，黄兴右手的中指、食指第一节都已被打断。
革命军且战且退，李准一方也死伤惨重。考虑到原订计划还远远没有完成，黄兴不敢恋战，率部退出，将一百二十多人分为三路：由他自率方声洞、朱执信等几十人出大南门，接应巡防营；四川、福建和南洋的同盟党人负责攻打督练公所；徐维扬另率党人40名攻打小北门。
