惨死
果不出赵良所料，该来的还是来了。公元前338年，在位二十四年的秦孝公去世，太子嬴驷即位，这就是秦惠文君（后称秦惠文王）。闭门不出已有八年之久的公子虔终于有了出头之日，他联合着公孙贾和一班宗室贵族诬告商鞅谋反，得到新君的支持后，立即带人前去实施逮捕。
商鞅仓皇出逃，一路跋涉，来到边境的关口时，早已累得疲惫不堪，想到旅店里住一宿，店主人却说：“商君有令，留宿没有证件的人，是要判罪的。”自己交不出证件，只得到僻静处坐待天明。借着清冷的月光，呆望黑黝黝的山岭，他不禁叹息道：“谁料这严法厉禁竟会落到自己的头上呢！”一时思潮澎湃，反而忘掉了那夜风的刺骨。朦胧闻得野店鸡啼，须臾已是此起彼应，料知关门将启，也不敢去找关吏，急急打点了，趁乱悄然混出关去，来到了魏国。偏偏魏国仍记着诱执公子卬的旧仇，不仅不予接纳，还以害怕得罪秦国为借口，重新将他送入秦境。
商鞅无奈，只得回到自己的封地商、於，召集亲信和民兵，真的造起反来。然而，以区区十五邑的力量对抗强秦，何异于以卵击石？商鞅率兵刚进至郑地，便被政府军击败，贵族们擒杀了他还觉得太不解恨，又把尸体弄到咸阳，车裂为五块，陈于市间示众。他的全家也同时遭到残酷的杀戮。
我们有理由推测，商鞅被杀前可能还考虑过同赵良谈话以后一直萦绕于胸，但始终没有想清的那些老问题。
他死了。以反叛的罪名被载入了秦国的史籍。然而他错了吗？后来，战国的大思想家荀子曾西游入秦，看到那里人民朴拙，百吏肃然，既无朋党比周，也无以权谋私，政务都依法办理，不见拖延和积压，不由大为称赏，惊呼自己发现了秦人连续几代不断取得胜利的原因。这原因何在？不正是商鞅的改革为秦国法治建设打下了基础吗？荀子的学生韩非明确指出：孝公、商君死后，“秦法未败”。原来，他们的继任者玩弄的也只是逆取顺守的政治策略，在消灭商鞅全家的同时，又把改革的成果全部保留了下来。汉人赞扬商鞅“尽公不顾私”，一心想着耕战，才造成了秦国的富有和强大，甚至还认为，连秦始皇能够统一天下，也应追因于六代以前的秦孝公。商鞅之于秦，功臣乎？罪人乎？实已不辩自明。而且，据说秦人妇女儿童都能背诵商君之法的条文，到战国后期，各国都有收藏商鞅著作的人家，他对战国历史的影响恐怕也是他同时代的许多人都无法企及的。
但他确实没有像百里奚那样赢得秦人的尊敬和怀念。车裂了的尸体陈于咸阳市，观者如堵，没有人说过一句同情话。这种结局，赵良曾于事前指出过，商鞅自己似乎也有预感，不然，就不会去同赵良进行那番关于是非功过的讨论了。
何以竟至于如此？商鞅到死也没有弄清楚。因而这寻找答案的任务也就留给了后人。
