除了外部环境的因素外，内部机制也是影响企业绩效管理能否正常进行的一个关键因素。甚至对于绝大多数企业来说，内部机制的重要性要超过外部环境——毕竟，外部环境不是企业家所能决定的，而内部机制则基本上是人为可控的。
很多企业的绩效管理都是刚开始做得干劲十足，像模像样，到最后却撞得头破血流，其中有很大一部分原因，就是忽视了内部机制的作用。内部机制不健全，就像是一个人的身体不健全一样，少了腿没法走路，少了口鼻没法呼吸，少了脊椎没法站立……企业也是如此，内部机制系统只要少了一个环节，其他的环节也都进行不下去。
绩效管理系统是绩效管理机制的一个核心要素，而系统就是指如何通过制度规范我们的行为，建立规则，告诉全体员工和所有部门，什么是该做的，什么是不该做的。
我们要通过建立起一个健全的内部机制，来实现各部门分工明确、各司其职，这样才能将整个企业的运转变成像人的四肢百骸一样，协调运作。
不少企业在建立绩效管理时，内部机制是这样建立的：制定出工作计划之后，通过表格，按部就班地布置任务，然后要求所有人员照此实行。通过收集的数据，对于各部门和个人进行总结与评定，最后加以改善。
这看起来没什么问题，但是一旦实际运作起来，就完全不是这么一回事了。说是要制定工作计划，可是这个计划要由哪个部门来做呢？谁来主导？做出来的计划如何考证和落实？还有布置任务的环节，由谁来布置任务？接受任务的对象是谁？这些任务是否合理？这些都应该被摆上台面。再有就是收集数据的环节，谁来负责收集和管理数据？最后，对于各部门和个人进行总结与评定时，谁来负责？总结与评定的标准是什么？
如考核主体多元随意、考核周期不合理、考核方法缺乏操作性、考核结果运用单一、对考核中发生的争议没有进行妥善处理等问题，最终都会导致考核半途而废、无功而返，达不到预期目的。而这些，都是一个不健全的内部机制所带来的坏处。
