10 时30分，第一批出发的人员全部登船完毕，伴随着岸边人群的狂呼呐喊，以“横滨丸”为首，“长门丸”、“名古屋丸”拉响汽笛陆续驶出宇品港，此后不久又有13 艘满载日本军队的商船从宇品港出发，16 日当天总计出发了16艘运兵船。第二军剩余的人员和物资分别在17、18 日与19、20 日再分为两批出发，其中一、二两批运输船的目的地都是联合舰队位于朝鲜大同江口的渔隐洞锚地，最后一批船则直驶花园口登陆点。
10 月19 日下午4 时开始，运送日本第二军的运输船逐渐到达渔隐洞锚地，一时间锚地内船满为患。21 日清晨，伊东祐亨在旗舰“桥立”上与第二军司令大山岩、第一师团长山地元治等陆军军官召开陆海军参谋会议，通报情况、协调制定具体登陆方案。出乎伊东祐亨预料的是，陆军在会上竟然对海军早已确定的花园口登陆点提出异议，海陆军遂发生争执。
陆军的观点认为花园口距离进攻目标金州城过远，进行如此长距离行军难免不被中国军队发现，可能因此造成金州城防御加强的不利局面。而且从花园口前往金州的路途上还横亘着3 条无法涉渡的河流，工兵架桥将会进一步阻滞陆军行动的速度，提议在尽可能接近攻击点的目标登陆，陆军最后指定的登陆点为花园口西南方的貔子窝。
海军对于陆军提出的观点全盘反对，坚持花园口才是最佳登陆位置，理由是陆上行军诚然是困难的事，但是如果不能安然登陆，则一切都无从谈起。海军结合多次对辽东海岸侦察得到的情报进行分析，认为如果在距离金州过近的海岸登陆很可能会遇到中国陆军自岸上的阻击，貔子窝一带已经发现有中国军队活动的踪迹，而且一旦被北洋舰队发现了后果更不堪设想。另外，貔子窝一带水深太浅，滩涂纵深大，大运输船只能停泊在距海岸5 里以外，如此一来舢板来回转运一次就有10 里，费时费事，因此海军坚持宁肯登陆以后陆军多走些路，也必须在海军容易实施登陆的地方上岸。乘客拗不过司机，激烈的争论进行到入夜后，陆军无奈同意了在花园口登陆的方案。
10 月22 日午后4 时，联合舰队高速通报舰“八重山”、装甲巡洋舰“千代田”以及炮舰“鸟海”、“筑紫”、“磐城”率先从锚地出发驶往花园口，伊东祐亨之所以选择这几艘军舰作为先导舰，主要是她们先前都参与过对辽东海岸的侦察，此次故地重游可谓轻车熟路。根据事先制定的方案，5 艘军舰到达花园口外海后将散列排开为后续的运输船队充当路标。另外，“千代田”舰将派出陆战队上岸侦察，如果发现有中国军队驻防就发射二三发火箭报警，倘若登陆场安全则在高处竖立日本国旗为号。
花园口是一处荒凉的海岸，零星散落着十几户中国人家，平日耕田牧海过着安闲的田园生活。时值初冬来临，田地里的收获已经结束，各家各户门口都堆着一垛垛的玉米、大豆，带着几分寒意的海风不断从村中掠过，夜幕降临后各家便都早早安歇。凌晨时分，一些警觉的村民听到了户外有不寻常的密集脚步声，其中还夹杂着怪异的言语，几户人家豢养来护院防贼的狗也都交相吠叫起来。
10 月23 日凌晨3 时38 分，“千代田”舰陆战队的50 名步兵和一名信号兵在海军少尉浅野正恭指挥下分乘两艘舢板船靠近了花园口岸边。为安全起见，浅野正恭只带了十几名士兵登陆，潜入村庄后发现并没有任何中国军队驻扎的迹象，随即一面在村口布置岗哨，一面在村庄右侧的小土丘上竖立起一面刺眼的太阳旗。
