孔子的晚年致力于学术，但应该说，他的心境可能是充满悲凉的。他的独生子孔鲤，他最喜爱的学生颜回、子路都先他而去，而且子路是惨死在乱刃之下，这都会给已经步入垂暮之年的孔子以巨大的打击。
在孔子73岁的时候，鲁国发现了麒麟，却受到戏弄。史书记载，孔子抱着麒麟失声痛哭，他应当是由此联想到自己的遭遇。这件事对孔子形成相当大的刺激，不久他就去世了。
古往今来，加于孔子身上的美誉数不胜数，最常用的可能就是“至圣先师”这一称号了，对此，孔子可以说是当之无愧的。中国人至今还认为，孔子是中国古代最伟大的教育家。孔子对于中国古代教育最大的贡献在于，他开创了一种新的教育模式，并确立了新的教学体系。
孔子开办私学，采用提问、启发、辅导式的教学方法，这种教学法不仅在中国流行了两千多年，而且影响到周边国家，成为东方独具特色的教学法。
孔子为自己的学生所编定的教材，就是中国两千余年间凡是识字者都要研读的“六经”，即《周易》、《尚书》、《诗经》、《礼经》、《乐经》、《春秋》，也简称为诗、书、礼、易、乐、春秋。在乐失传以后，其余五种被称为“五经”。
在孔子的“六经”教学体系中，大体说，诗的教育，是文学修养与外交辞令的培养，书的教育，是对以前的政府文诰的学习，可以看成是从事应用文写作练习。这两者还有一个作用，即用来练习当时的普通话——雅言。礼、乐两科的教育，是孔子对此前教学体系的继承，可能具体内容有所调整。孔子新增加的两种课程，《易》实际上讲的是人生哲学，《春秋》是历史。当然，《尚书》也可以看成是历史书，相对于孔子那个时代来说，《尚书》是讲远古历史的教课书，而《春秋》是近现代史的教课书。六经中还都贯穿着孔子的治国思想与伦理道德思想。
孔子的六经教育，若是用今天的分科来讲，涵盖了历史、哲学、文学、音乐、语言学、政治学、伦理学、思想品德、社交礼仪、应用文写作等方面的内容，几乎涵盖了现代人文学科的所有内容，还既有理论的培养，又有能力的锻炼。应该说，孔子的教育在当时是相当先进的，难怪乎孔子的弟子有的是当时著名的外交家、政治家，也有的是闻名诸侯国的学者，还有的是著名的大商人。
一般认为，“六经”中除了《春秋》为孔子的著作之外，其他五种都是孔子编定的。在孔子去世以后，其弟子回忆他的言论，加以整理，编辑成书，这就是《论语》。《论语》一书中也包含一些孔子的高足弟子的言论，可以说，是孔子及其重要弟子的语录。
