1945年新年刚过，刘邓签署命令，任命刘华清为军分区政治委员；同年底，又任命他为第二纵队第六旅政治委员。从此，刘华清成为刘邓麾下一名骁勇善战的优秀指挥员，深得刘邓的赏识。
1949年年初，刘华清被任命为新组建的第十一军政治部主任。渡江战役结束后，刘邓将主持筹办军政大学、为解放大西南培养输送知识分子干部的重任托付给刘华清，并任命他为二野军大党委书记兼政治部副主任。
开学三个月后，邓小平政委来到军大。此前，他仔细批阅了刘华清以校党委名义起草上报的《关于军大教学情况及学员思想动态的报告》，并听取了刘华清关于学员思想上存在的各种模糊认识问题的专题汇报。1949年9月12日下午5时，邓小平面对一万多名青年学员，开始了他长达四个多小时的生动演讲。
邓小平演讲的题目叫《过关》。“古有关云长‘过五关斩六将’，今天的革命青年要过的关无数，但大关只有三个：一是帝国主义的‘关’，二是封建主义的‘关’，三是社会主义的‘关’。”邓政委告诫青年学子，“这三个大关，每个参加到革命营垒的人必须过，问题是有的过得去，有的过不去。”
邓政委的演讲如行云流水，大气磅礴，极富说服力和感染力，深深吸引了全场青年学员。半个多世纪过去，刘华清始终认为，一万多名长期生活在国统区的青年知识分子能在短短四个月之内转变为意志坚定的革命者，邓小平的报告所起的教育作用是不可估量的。
在将一万多名青年知识分子“速成”为新中国军政建设合格人才的实践中，刘华清最大的收获是积累了团结、教育、转化知识分子的宝贵经验。
1950年3月初，刘华清组织二野军大从南京迁抵重庆。4月，校名奉命改称为“中国人民解放军西南军区军事政治大学”（简称“西南军大”），刘华清继续担任军大党委书记兼政治部副主任，主持学校全面工作。
主政大西南的邓小平曾形象地称他面临的急迫任务是：90万、6000万、60万。
