这时已经过了9点钟，风很大，漫天黄沙，夜里很冷。但慈禧没有耽误时间，马上派出一队士兵，到城西醇亲王府，用8人抬的黄轿，迎接小皇帝进宫。同时又派恭亲王留在同治皇帝遗体身边，这是怕他生出事端而对其进行的羁押。在宫内宫外，由荣禄严密看守，这都是慈禧的手段，才能在不动声色间压倒反对的人。这些人虽有反对意见，但才能都远远不如慈禧。有人说慈禧的胜利，是她命运太好，其实不是这样子的。我看慈禧的性格和才能，可以称得上东方的拿破仑。还没有到半夜，小皇帝已经在宫中即位，他一直啼哭，就像知道他以后在宫中的不祥命运一般。他的母亲是慈禧的妹妹，也一同入宫。此外还有几个奶妈。刚登基就先到同治皇帝尸体前跪拜，这是历代的规矩。当时皇帝只有几岁，于是两位太后又开始重新监国，并以两宫太后的名义，下达一道谕旨：
大行皇帝无子，不得已乃以醇亲王子载湉入嗣文宗，承袭大统。俟嗣皇帝后生皇子，即承继大行皇帝为子云云。
而同治皇后的遗腹子，就绝口不再提，于是大家知道皇后的希望都完了，但也无能为力。王公贵族们按照先前的习惯，共同上奏，请两宫太后共同垂帘听政，两位太后下诏答应，说皇帝太小，时势艰难，不得不听从大臣们的请求，继续复出垂帘听政，希望国家大事能够顺利等话，都是一些形式上的东西。
慈禧又下诏命令暂停修理西苑和颐和园的行动，说这是国家大丧的时候，没有心情再这么做。其实是由于这时候太后不能离开宫中的缘故。慈禧能够随意地破坏祖宗家法来立醇亲王子的原因，在于她平时得到人心，处理事情比较有章法，因此被人信服。
新立的小皇帝，身体瘦弱，大家都认为他长大之后，一定很难有子嗣，也有人劝过慈禧，但慈禧根本不加理会，这明明是慈禧贪恋权势造成的结果。到1908年，也就是光绪三十四年，皇帝、太后相继驾崩之前，外界经常谈论皇帝登基时兆头不好，寿命不成，活不过太后。在皇帝亲政之前，慈禧一定能长寿。如果再次经历一次废立皇帝的大事儿，就能继续执掌朝政，但这种情形后来没有实现。慈禧的确撤销帘子，把权力交给皇帝，要不是戊戌政变，加上害怕南方革命，恐怕新立小皇帝的事情还会发生。
