问题不在于有没有数学运算能力，而是学生对待这个问题的态度无法与所采用的数学模式相一致。我们大多数人直觉不喜欢背叛朋友的说法，因此在这个游戏中，“理性的”方法往往没有多大的吸引力。当我们一开始尝试进行囚徒困境这个游戏时，会有各种变量影响我们的思考，不仅仅是在监狱里要待多长时间这个因素。如果我出卖了我的朋友，在镜子中，我会看到什么样的自己？被我出卖的朋友会怎么看我？如果其他朋友发现了我的背叛，他们会怎么对待我？除了为这个困境设计的简单矩阵，还有其他各种各样的因素需要考虑。可能是出于情感方面所作的一些考虑，但这些考虑确确实实地影响了我们在现实生活中的行动，甚至在设计这些游戏要求人们丢掉情感的包袱时，这些考虑依然会影响人们的决定。政治学者阿迈达指出，事情原本的样子是，不了解理性选择理论逻辑的人在囚徒困境中并不愿意背叛彼此，即便当他们彼此是陌生人时，也是如此。
若大多数人学会了以理性方法来进行囚徒困境这个游戏，又会怎样呢？我们的思维会变得一团混乱，毫无希望吗？还是这个评估自身利益的理论模型无法适用于我们思考的每一件事？我们可以通过唤醒各种各样的情感“回报”，来挽救理性选择模型。比如说，一个人的所作所为似乎违背了他自身的利益。他很乐意通过无私的自我牺牲来赢得他人的尊重。也许在别人的尊重中，他会感到快乐，因此，似乎所谓的自我牺牲就是可以给自己带来利益的努力付出，这个人通过这种付出使自己想要的快乐达到最大化程度。这个想法并不疯狂。但就我们自身的经历而言，这也不是一个很好的选择。
