连朱元璋的“群众反贪”，有时候也反出冤案来。《大诰续编》里记录，安吉县有个金姓农民，拖欠了两年地租，东家地主去讨要，金农民居然手拿《大诰》，把地主绑到南京城，让朱元璋治罪。不明真相的沿途官员们，居然也敲锣打鼓，拿着反腐败的阵仗礼送他进京。可怜的地主，差点就冤死在反贪运动里。
朱元璋时代最普遍的刑罚，就是杖责。这一条刑罚，主要还是针对官员的，杖责的量刑，通常是六十大板。官员遭到杖责的刑罚，一般有几种普遍原因：贪腐、渎职、惹怒朱元璋等，却也有些另类的原因。比如朱元璋规定，官员如果在家里吃饭的时候，请妓女来唱歌，就要被杖责。另外，如果官员所在地，发现了身体残疾却没人管的老百姓，同样也要杖责。此外有些原因也比较“倒霉”，比如朱元璋的户部尚书茹太素，因为写的奏折太唠叨，开篇五千多字还没切入正题，也被朱元璋拉出去大棒暴打一通。
最让朱元璋没脾气的人，却是朱元璋的长子——太子朱标。随着朱标渐渐年长，朱元璋开始放手让朱标处理国事，但深受儒家思想熏陶的朱标，却常常和朱元璋发生分歧，并且往往和朱元璋针锋相对，直言表达。《明史袁凯传》中记载，朱元璋曾让朱标来处理刑部的案件，没想到朱标给每个案件都罪减一等，从宽处理。朱元璋大怒，问辅助朱标处理案件的御史袁凯，皇帝和太子，究竟谁处理得对？吓得袁凯结巴了半天才说：“皇上是执行法律，太子是天生仁厚。”总算让朱元璋消气了。
但有些事，就没这么容易调解了，“胡蓝大案”发生后，朱标的老师宋濂也被牵连其中。《明实录》上记载，朱标曾为宋濂向朱元璋求情，说到最后朱元璋急了，脱口而出一句：“等你当了皇帝再赦免他吧!”这话“潜台词”可丰富了——小子，你想提前接班啊！没想到，朱标反应更激动，居然纵身一跃，跳下了宫中的太液池。这下可把朱元璋吓坏了，吃了一肚子水的朱标被捞上来后，朱元璋不吃不喝，焦急地守在儿子身边。直到朱标活过来才发现，事后所有下水救太子的人，朱元璋全部记下名字，脱了鞋子下水的一律杀头，没脱鞋子下水的则官升三级。朱元璋的理由是：太子都危在旦夕了，你们难道还脱了鞋子再跳水吗？
