9月5日，起义军先头部队到达长汀，数百名伤员被送进傅连暲主持的福音医院治疗。福音医院本来是外国人办的，五卅运动后，外国院长跑了，医生和职工们便推举傅连暲当了院长。当时傅连暲虽然不是共产党员，但他关心、同情北伐革命。起义军到汀州来，他和城里的医生以福音医院为中心，利用极其有限的治疗手段，为部队的伤病号治疗。大部分伤员和病号经过治疗都重返部队。后来成为人民解放军著名将领的陈赓和革命老人徐特立，都是经傅连暲的治疗才得以康复的。傅连暲后来参加了红军，成为红军中著名的医生。
在长汀，前敌委员会对攻取东江的计划又进行一次详细的讨论。当时有两种意见。周恩来和叶挺主张：“以主力军由三河坝经松口取梅县，再经兴宁五华取惠州，以小部分军力（至多两团）趋潮汕。”这样做有两个好处：（1）潮汕敌军兵力空虚，地势又无险可守，预计可不战而得；（2）如果先以主力取潮汕，再折回来取兴宁、五华，攻惠州，就过于迂缓，使敌人有集中兵力、抢占有利地势以攻击我军的可能。
另一种意见，主张“以主力取潮汕，留一部分兵力于三河监视梅县之敌，再经揭阳出兴宁、五华取惠州”。他们主要是担心敌人死守潮汕，不能很快攻下，就难以取得国际的接济，且梅县、兴宁、五华一带都是山路，部队不便行动，给养也会发生困难。而走三河坝到潮汕，可以顺韩江而下，水陆并进。由于苏联顾问等坚持这个主张，而一般军官在长期行军后渴望得到一个地方休息，也赞成这种主张。后来，就按多数意见作出决定，采纳了后一方案。此次行军路线选择，对以后起义军的迅速失败有着直接的影响。
