清朝官员看到罗教庵堂已经成为水手们的聚集中心，虽然承认庵堂“别无夜聚晓散及煽惑民人之事”，仍担心久而久之会滋生事端，遂于雍正五年对罗教庵堂进行查禁。为了避免罗教庵堂被查禁后水手们无处栖止而滋生事端，关闭了40多所庵堂，没收了庵堂所藏的罗经、罗像，把其余的30多处庵堂改为水手居住的“公所”，不许再信奉罗教。江苏巡抚陈时夏在接到刑部有关查禁罗教的咨文后，也对本省罗教庵堂进行清理。发现这些庵堂房屋不过数间，供三世佛，诵经做会，非僧非道，每与漕运水手同教往来。粮船来南，多以米粮资其食用，或粮船水手有疾病流落者，各庵之人亦资其盘费。陈时夏在苏州共查出大乘教（罗教变名）庵堂12处。经过雍正五年的查禁，漕运水手中信奉罗教者并未减少，而且各庵内仍藏罗经、罗像，居住在公所里的水手不久便又故态复萌，继续信奉罗教。乾隆三十三年清廷再次查禁罗教，乾隆皇帝吸取了雍正年间的教训，当浙江巡抚永德奏请仍然沿用雍正年间成例，把罗教庵堂仍改为公所时指出：从前虽经李卫查毁经像，而房屋尚存，以致故态复萌，各庵内仍藏罗经、罗像，是其恶习难返，非彻底毁禁，不能禁绝根株。如果沿用前法，则数年之后，查禁稍疏，伊等势必又将公所变为庵堂。至于回空水手的栖息一事，则不必官为筹办，由水手们自行解决。遂把罗教和大乘教庵堂彻底摧毁，拆下之木料与地基，也估价后留充地方公用。
（3）漕运水手行帮向青帮的演化
罗教庵堂被毁后，其活动中心已经不复存在，栖息于此的年老无依水手也失去了生存的依靠，于是把活动中心从陆地转移到船上，建立了“老堂船”。每帮有老堂船一只，悬挂罗祖画像，分派一人专管香火及全帮水手用钱的账目，称为“老管（老官）”。
