1963年11月22日，肯尼迪到德克萨斯州的达拉斯市访问。中午时分，肯尼迪乘坐一辆敞蓬汽车游街拜会民众，行至一个拐弯处时，埋伏的枪手向他开了枪，子弹命中头部，送往医院后很快不治而亡。数小时后，疑凶李·奥斯瓦尔德被警方抓获，但此人两天后即被枪杀，使案情变得十分复杂。林登·约翰逊宣誓就任总统后下令组成以最高法院院长瓦伦为首的调查组。一年后，调查组提交报告认为整个事件全是李·奥斯瓦尔德一人作案，但美国民众普遍不相信这个结论。此后数年，民间有很多人士尝试调查此案，并出版了相当数量的畅销书。在层出不穷的结论中，古巴政府、中央情报局、副总统约翰逊都曾被列为主要怀疑对象。当局宣布到2047年才能解密调查报告。
1963年11月，为了纪念这位帮助美国宇航局制定最伟大决策的总统，佛罗里达州卡纳维拉尔角发射场被命名为"肯尼迪航天中心"。肯尼迪航天中心是世界最大航天器发射场，曾以发射过"双子星座"飞船、"阿波罗"飞船、航天飞机驰名全球。这是因为肯尼迪航天中心纬度较低，向东发射火箭时可利用地球自转，帮助火箭加速，有助于卫星入轨，有利于携带更大更多的航天器。同时，东临大西洋，既有利于运输，又利于安全。
肯尼迪航天中心经常对外开放，每逢重要发射，都会有成千上万的游客到此观看。肯尼迪航天中心内部戒备森严，游客只能造访警戒线之外的访客中心，在这里参观航天飞机模型、观看太空影片、购买书籍纪念品之类。从访客中心向海角深处再穿过十几千米的灌木区，才是真正的航天中心工作区。
肯尼迪航天中心、约翰逊航天中心、马歇尔太空飞行中心，这三个航天中心貌似一样，实则各有分工。肯尼迪航天中心主要负责发射，而约翰逊航天中心主要负责指挥、追踪和宇航员训练。马歇尔太空飞行中心是美国火箭的研发中心，二次世界大战后，冯·布劳恩等德国火箭专家在此为美国制造出了一系列火箭。美国正是借冯·布劳恩"丘比特"火箭将人造卫星送上了天，借"土星5"号火箭将"阿波罗"飞船送上了月球。所以，美国所有太空活动，几乎都离不开马歇尔太空飞行中心和斯坦尼斯航天中心的火箭。
