晚11时30分，美国宪兵把他们分两批押进一所佛堂，在各自执行绞行的命令书上签字。首先被押进佛堂的是东条英机、松井石根、土肥原贤二和武藤章。他们签名后，每人喝了一点葡萄酒，为上绞架壮胆。随后，这7人皆换上美军救护工作服，并被戴上手铐。为防止有人在绞架上抓住绞索作垂死的挣扎，行刑的美国宪兵用两根结实的布条，一头系在手铐上，一头绑在他们的大腿上。
刑场设在监狱右侧的一间宽敞的房间里。绞刑架是用安南出产的铁木制作的，绞架的下方，是长宽各9尺、高8尺的底座，底座四面有板壁围护。台座的南侧，有宽5尺的13级台阶通往台上，两边装有扶手。台顶长8尺，宽5尺，是4块木板构成的由电流控制的活动踏台。行刑者只要一按电钮，木板便翻立到一边。踏台上有两根高5尺、直径约5寸的圆柱，圆柱的顶端横杆上，悬着7根打着活动套结的粗麻绳。距绞刑台数米处，是主执行官的指挥台，高约9尺，有栏杆围护。刑场的南面，设有监刑席，一排长条桌上铺着天蓝色桌布，桌上摆着7盆散发着香气的红色玫瑰花。
监狱内外戒备森严，从监狱到刑场的百米通道两旁，每隔10步，便有两名端着自动步枪的美国宪兵相对而立。
11时40分，典狱长阿尼斯少校率领主执行官克里尼密斯宪兵中尉与14名执行宪兵、8兵执勤宪兵、4名法医，列队进入刑场。除典狱长与法医之外，腰间皆佩带手枪。执勤宪兵分立于监刑席两侧，执行宪兵和法医将绞刑台再次检查了一遍。一切准备就绪，天棚上的数十只电灯齐明，把刑场照耀得如同白昼。
11时50分，负责监刑的美国代表西波尔德博士、中国代表商震上将、英国代表巴特斯克中将、苏联代表迪利比扬格中将等，在美军将领基南和韦伯的陪同下，进入刑场。典狱长阿尼斯少校陪同他们在监刑席就坐。
当挂在东面墙上的自鸣钟敲响12下时，东条英机、松井石根、土肥原贤二与武藤章被宪兵押入刑场。执行宪兵拿着他们的从不同角度拍下的照片，一一进行对照，验明正身。接着，克里尼密斯走上主执行官指挥台，下令行刑。
这时，东条英机低声说：
“请松井领大家喊万岁。”
松井石根喊了一句：
“天皇陛下万岁！”
东条等三人跟着一齐喊，声音沙哑而低沉。
按照抽签顺序，第一个走上绞刑台的是土肥原贤二。两个执行宪兵押着他，走完通向死亡的13级台阶，然后停下，命他立正站好。一名执行宪兵先用英语，而后用日语命令道：
“土肥原贤二，再向前跨进一步！”
等土肥原站在活动踏板的中心，他又命令道：
“土肥原贤二，原地转过身来！”
土肥原转过身，面向监刑席，嘴唇嚅动着，听不请在说些什么，也许是在祈祷护佑神保佑。此时，向土肥原发命令的执行宪兵，把黑布头罩套在土肥原头上；另一名执行法官拉过第一根绞索，套在他的脖子上。
