光绪帝览折后，即令军机处拟旨照行，然而军机大臣刚毅却劝阻说：“此乃祖制，不可轻废，请下部议。”
光绪帝申斥道：“部臣据旧例以议新政，惟有驳之而已。吾意已决，还议什么？”
刚毅仍劝谏说：“此事重大，行之数百年，不可遽废，请皇上细思。”
光绪帝怒声训斥道：“你要阻拦我么？”
刚毅并不胆怯，固执地说：“不是要阻拦皇上，只是此事重大，还是请皇上请皇太后懿旨为好。”
宋伯鲁见状，便与杨深秀联名奏劾许应骙庸妄狂悖，腹诽朝旨，守旧迂谬，阻挠新政。光绪帝阅奏后，遂谕内阁命许应骙按所参各节明白回奏，讲讲清楚。
可是，许应骙在回奏中却掩饰宋、杨所参内容，并转诋康有为，说康有为终日联络台谏，夤缘要津，托词西学，以耸观听；又私行立会，聚众至二百余人，逞厥横议，广通声气，袭西报之陈说，轻中朝之典章，其建言既不可行，其居心尤不可问。若非罢斥驱逐回籍，长住京邸，必勾结朋党，快意排挤，摇惑国是。
光绪帝见许应骙气焰颇张，只好对他加以勉励，并不得已去颐和园向慈禧太后问安请懿旨，经慈禧太后令准后才颁发废八股改试策论的谕旨。
废八股的诏书下颁后，众多守旧官员相顾失色，后又窃窃然议阻实施。御史文悌读废八股诏书后痛哭流泪，他与黄桂鋆到处奔走，策划联名请复八股。运动不成后，文悌即上折参劾宋伯鲁、杨深秀言官党庇，诬罔荧听，其奏劾许应骙是诬参朝廷大臣。接着，文悌又参劾康有为任意妄为，遍结言官，把持国事；云京畿道监察御史陈其章、山东道监察御史宋伯鲁、杨深秀、江南道御史李盛铎、翰林院侍读学士徐致靖、内阁学士阔普通武等人所上奏折，几全由康有为捉刀代拟。
光绪帝见文悌敢逆诏书，又连上两折参奏朝臣，即降谕斥责文悌台谏结党攻讦，各立门户，最为恶习；并言文悌不胜御史之任，着回原衙门行走。维新派大臣见了此谕，都感到快慰。康有为生怕废八股事有反复，急忙又代杨深秀拟折，请刑部定律，凡有复言更易国是，规复八股者，科以莠言乱政之罪。杨深秀折上后，光绪帝立即准奏。这样，朝中议复八股者不得不收敛起来。
然而八股一废，使向以八股入士的生童举子骤失所业，因而他们恨康有为特甚，直隶士人曾想聚众殴打康有为，甚至要行刺他。康有为之弟康广仁和梁启超等人听到这一消息，告与康有为，劝他暂避一下。可是康有为只是“呵呵”一笑了之，仍为维新之事日夜筹谋。
