动画制作过程中，故事组还在继续润色剧本，新的点子在不断加入。其中有一个是巴斯光年在匹萨行星饭店遇到了一群会吱吱叫的外星人玩偶。这个点子是在和迪士尼的导演、编剧和动画师们"头脑风暴"时产生的。剧本中安排巴斯被拖进一个火箭形状的抓娃娃机里，几个月来大家都在想要在机器里放什么样的玩具，巴斯光年碰到它们又会发生什么事情，但没什么令人满意的想法。（未经采纳的点子有：玩具熊和装饰着太阳镜的塑料匹萨条。）会议上，正当大家一筹莫展的时候，有人说出了关键词：抓手。突然就好像有人打开了水龙头，各种想法都涌了出来。"我们开始回想我们所能回忆起的电影里的一切东西，并为此反复争论。"斯坦顿说，"你会听到有人说'别为爪子争了！'，或者'就按爪子的意思办！'之类的话。"最后，《美女与野兽》的故事画师克丽丝·珊德（Chris Sanders），画了一个独特的三眼外星人的草图，这个形象最终被电影采纳。
动画制作以一周完成三分钟片段的速度稳步发展。在制作进程中，由于电影胶片都是一段一段完成的，又没配上音乐和加上音效，工作人员很难想象完成后的电影会是什么样子。
"我没理由相信它会是个好作品。"巴斯尔回忆道，当时他刚拿到加利福尼亚技术学院的博士学位，在灯光组，"我知道约翰绝对是个才华横溢的短片动画师。我读过一些作家的作品，他们可以写出很好的短篇故事，也能写出丰满的长篇。这是很难掌握的技巧。我不觉得约翰有这个技能，他做不成一部长篇电影。"他（指拉赛特）期望做出一些东西，可以让动画师和动画片爱好者都觉得有趣，但这样的东西可能不会有特别多的观众。
"我加入这个项目是想获得实际经验，"他说，"我想，嗯，这将成为第一部电脑制作的动画电影，所以不论结果如何，成为一份子都将是有趣的经历。"渐渐地，巴斯尔发现拉赛特具有不可思议的能力：他可以从宏观层面来指导整个电影，也可以从微观层面处理当时遇到任何细节问题。"就拿单独的画面帧来说吧，这是非常细致的活儿，他总是能认识到一个画面在更大的故事叙述背景中的位置。"巴斯尔回忆道，"他会这样说：'这是这个角色第一次遇到这个情况'，或是'他眼中的闪光要处理好，这非常重要'。"巴斯尔开始相信：约翰知道自己在做什么，这部电影将非常精彩。但在皮克斯有一个人不这么认为，他对《玩具总动员》缺乏信心。
