陈宦对川军的调整如下：周骏第一师首当其冲，原一师辖两旅共六团另三营的兵力（步兵四团，骑、炮各一团，工、辎、宪各一营），被压缩成一师仅辖一旅共四团另三营（步兵两团，骑、炮、工、辎、宪编制不变），且旅长改为陈宦的湖北老乡——士官四期生熊祥生；而刘存厚第二师虽尚未被裁，但亦被插入陈的湖北武备学堂学弟雷飙做旅长。
但随即护国战争爆发，裁军遂成虚话。陈宦只得回过头来，又将周骏第一师紧急恢复成两旅（熊祥生旅及特科不变，增加黄鹄举旅）。
故至护国军入川时，川军情况如下：
周骏第一师，分驻重庆、泸州；
刘存厚第二师，分驻叙永、成都；
新编的第一混成旅黄鹄举（四川武备）部，驻江津（后并入第一师）；
第二混成旅钟体道（四川武备转陆大）部，驻顺庆（今南充，后升为第三师）。
此时川军各部在名义上虽服从于袁世凯、陈宦，但双方矛盾甚深。故一待护国军入川，川军便纷纷叛离——先是刘存厚于1916年1月31日在泸州纳溪率先倒戈反袁，稍后钟体道也于5月初在川北宣布护国。
老袁亦深知川军靠不住，故护国军出师北上后，他即于1916年1月5日动员北洋军大举南下，两路出师讨伐云南：一路以虎威将军曹锟督北洋军主力一部入川，对阵蔡锷；另一路则以马继增率北洋第六师和第十八混成旅南下入湘，拟自湘黔道入黔，以侧击云南，威慑贵州。
就主战场四川而言，入川北洋军共计有曹锟的第三师主力吴佩孚旅，张敬尧的第七师全部，第八师王汝贤旅等部，再加上陈宦带进四川的冯玉祥等三个混成旅和其他一些零散部队，仅麇集于四川一地的北洋军主力即达四万余人。
当时北军素轻滇、黔军，每每称一两师兵力便足以平定云贵，袁世凯此次单是动员北洋嫡系部队就达到三个整师另四个混成旅的规模，也不可谓轻敌了。
与北洋军的宏大阵容相比，护国军则备显寒碜。
且举出四川的蔡锷一路为例。
此路虽然声势浩大，但人马却少得可怜（李烈钧那路就更是说不得了——他手里的人马还是这路挑剩下的），对外号称是一路军，实际不过五千来人，更要命的是，该路所携弹药不敷一月之用，军饷亦不足两月……
原来护国大义之下，乃是掩不住的寒酸！
须知云南之穷，有清一朝都是有名的。自清末始建新军起，便需四川协饷，年供八十万两白银方足用。而此次护国起事，经济上仅有李烈钧从南洋华侨处募得的三十万元，再加上罗佩金尽数变卖家产，亦不过凑得十二万元，合计四十二万元，其不敷用度，可想而知。
可尽管财困兵寡，蔡锷敢于北伐，也不是全无底气的。
首先，云南地势偏僻险要，纵使进不能攻，退亦可守，即使不能逐鹿中原，也大可以割据称雄。
其次，滇军论数量虽然只有两师一旅，加上警备队共四十营的兵力，但其部队素质，则远胜于急速扩充后的北洋军。滇军中的高级军官，大多是日本士官学校出身，而中下级军官，也均是云南讲武堂毕业，学术优良，思想纯正，又具有革命精神，绝非北洋系那些老朽不堪的大烟鬼可比。
再次，滇军所用的军械，也均是清末购自德国克虏伯厂的精良产品——单是光绪末年，云贵总督锡良就向德国订购了管退山炮五十四门，每门附弹一千发；马克沁机枪四十九挺；新式五子步枪一万多支，每支附弹一千发；十响手枪一千多支。
