发芽的豆类和种子苗芽（例如小扁豆芽和豆芽）、紫花苜蓿的芽不能食用。苜蓿芽、其他豆类或者苗芽都含有较多刀豆氨基酸，这是植物苗芽中含有的天然有毒成分，属于毒碱性氨基酸，可能引起哺乳动物的自身免疫疾病，使免疫系统丧失调节机能。因此，没有慢性骨关节病史的人在食用了苜蓿苗芽之后也会突然出现关节炎症状。实验证明，一直健康的猴子会因其食物中增加的苜蓿芽而患有系统性红斑狼疮。
大豆和豆制品，包括豆腐、印尼豆豉、日本豆面酱、酱油、有机氨酸豉油（又名有机酱油、健康低钠豉油）、有机类蛋白质、豆油以及所有其他种类的豆制品都应当被禁止。它们含有高脂肪、高钠成分，身体吸收营养时容易受到有毒物质的影响。
各种高蛋白物质、所有种类的豆制品都应当被禁食。晒干的豆类和豆荚也应当禁止食用。
坚果和种子，包括杏仁、杏核、向日葵种子、蓖麻种子、豌豆、腰果以及其他的坚果和种子，都是格森灌肠排毒疗法食谱所禁止的。这些物质含有过高的脂肪和蛋白质。并且，在烤制、烘焙过程中，加入了盐分；同时脂肪也已经发生改变。这样的坚果和种子非常可怕。
所有种类的油和脂肪，除了用新鲜、天然、有机食物制成的蓖麻油之外，都不能食用。
任何情况下严禁吸食尼古丁。
咖啡和茶类的饮用应当减到最低限度，薄荷、甘菊、菩提树花、橘树花和其他少数几种茶类除外。
红茶、绿茶和其他非草本的及含有咖啡因的茶品都应当被禁止，因为其中含有较多不适合饮用的芳香酸及咖啡因成分。格森医生认为芳香剂会引起人体的过敏反应。
黑胡椒和红胡椒等香料的刺激性都很强。它们含有过高的芳香酸物质。辣椒粉、墨西哥胡椒粉等也同样具有很强的刺激性，并且会阻碍疾病的治疗。但绿色的、黄色的、甜的红辣椒可以不受限制地食用。
蘑菇并不是蔬菜，而是一种真菌，其中含有结构复杂的蛋白质，并且不容易被消化。蘑菇提供的营养物质也非常有限。
经过提纯和精炼的白糖和红糖也要禁食。
糖类、蛋糕、松饼、馅饼。由于其中含有有损健康的成分，诸如脂肪、油、精炼的糖类、盐、苏打、烘烤粉或者奶制品，所以应当被禁止。
酒精禁止食用。酒精是有毒的，会限制人体吸氧能力，阻碍肝脏解毒和排毒功能。
盐、含重碳酸盐的苏打、烟熏鱼和香肠（腊肠）应当完全禁食。
所有人工加工处理过的食品，例如瓶装的、罐装的、冷冻处理的、防腐的、精炼的、腌制的、熏烤的或者使用了硫磺的食物都应当禁食。
烘烤粉和制作烘烤粉用的面粉中含有较多的钠离子和铝离子，而它们都是有剧毒的。无铝、无钠、无盐的烤粉，例如费德维特（一种以钾离子为基础制成的烤焙粉）在某种情况下还可以经常食用。
大麦粉（包括未磨成粉的大麦）也要禁食；当然也包括所有的意大利面食，比如通心粉或者面条。
各种奶制品，例如牛羊奶及其奶制品都禁止食用。具体包括奶酪、奶油、冰激凌、黄油、冰镇牛奶、酪乳。某些特殊情况允许食用的奶制品除外。通常，奶制品的脂肪含量都相当高。奶酪含有65%的脂肪，并且钠含量也很高。市场上销售的酪乳是经过处理的，加入了调料和稠化剂，同样含有脂肪和钠元素。
当然，新鲜的蛋白质，不含任何添加剂的酪乳，可以在接受治疗6～12周后食用。
在接受格森灌肠排毒疗法后一年或一年半之内，不要食用任何蛋类、鱼类、肉类、黄油、奶酪、奶制品。在接受治疗两年后，或者完全康复之后，可以根据个人的口味偏好适当做出调整。
含氟成分的物品也不得使用。例如香水、牙膏、漱口液、干发剂、美容设备、化妆品、腋下除臭剂、唇膏和洗液等，在任何情况下都不允许使用。
严禁使用一切铝制蒸煮器具，如微波炉、压力锅和蒸汽锅等。
