解决了足利义昭，信长很快就歼灭了一乘寺、木户城、田中城、淀城等畿内势力，返回岐阜。这时，传来一个大好消息。
淡路守阿闭贞征是山本山城城主，作为浅井重臣的他成为羽柴秀吉的说降对象。在羽柴秀吉的运作下，阿闭贞征倒向信长一方。这个消息对信长来说是大好消息，他立刻出兵前往解决浅井和朝仓这两个夙敌。八月十日，信长绕过小谷城，屯兵山田山，朝仓虽然倾巢而出，但是就在山田山被信长拦住，朝仓与浅井无法合兵。实力单薄的浅井保护小谷城都不足，当然不会冒险跑出来，所以信长决定首先解决朝仓援军问题。十二日，信长冒着风雨离开虎御前山本阵，攻克大岳，把朝仓和浅井之间的联系彻底切断。信长判断：朝仓一定会因此退兵。
果然不出所料，朝仓于十三日引兵退去，在川以后，朝仓已经变成了惊弓之鸟，每次都有模有样地出兵，但始终不敢进行决战。这一次也是如此。朝仓军在恶虎拦路的情况下，丢下浅井退兵，而且退得很没战略性，行动仓促，军容混乱。这一情况被信长看在眼里，他很快判断出了朝仓的退兵路线，在刀根山一线，织田军追上了朝仓军，一阵混战以后，朝仓义景丢下了3000多具尸体仓皇而逃。朝仓家的人才在这次刀弥坂合战中损失殆尽，连投奔越前的斋藤龙兴也在这场合战中阵亡。
十八日，信长兵临一乘谷城，当日破城，将这座战国三大文化中心之一的名城付之一炬。朝仓义景逃到大野郡山田庄，向朝仓氏中唯一仍有实力的朝仓景镜求援。朝仓景镜却不想为朝仓义景殉葬，他立刻包围了朝仓义景所在的据点，逼迫朝仓义景自杀。八月二十四日，朝仓景镜投降并献上义景的头颅，朝仓家灭亡。
解决了朝仓的信长调过头来攻打小谷城，外援断绝的浅井家灭亡只是时间问题了，八月二十七日夜，织田军的羽柴秀吉开始发动攻击，占领小谷城中段的京极丸。住在本丸的浅井长政和住在山下小丸的浅井久政的联系被切断，信长派出使节要求长政立刻投降，并说久政已经投降。浅井长政摇头不信，正应了那句话“知父莫如子”。长政将阿市和女儿送出城外后，决定顽抗到底。
山下的小丸和京极丸陷落，浅井久政切腹。次日，小谷城本丸陷落，浅井长政和赤尾清纲自杀。浅井长政的年仅十岁的长子并非阿市所生，被处以磔刑。浅井家灭亡。
信长曾经对浅井长政寄托了很大的希望，认为他是能帮助自己平定乱世的助手，阿市和长政的婚姻虽然是政治婚姻，但也有信长对“近江之鹰”的欣赏和信任的成分在内。但这只近江之鹰却在父亲和家臣的胁持下走上了和信长敌对的道路。从小失去母爱、面临众叛亲离局面的信长又一次被自己的妹夫出卖，他的失望和怨恨可想而知。第二年新春，在新年宴会上，织田家的群臣云集岐阜，恭贺新春。信长在席上拿出了各种精美的食物和华丽的器具，席间有两件器具让所有的人惊讶之余还有点反胃：信长将朝仓义景、浅井久政、浅井长政三人的头骨漆上金漆，当做酒具，盛满酒遍请诸将。这些在战场上血腥杀戮的猛将也不禁觉得毛骨悚然。
历史上，以敌人的头颅为器具的典故比比皆是。中国春秋末年，晋国的韩、赵、魏三家联合灭掉智氏。赵襄子无恤把他最痛恨的敌人智伯的脑袋当成了夜壶。不知道赵襄子对着人脑袋是不是能尿得出来，反正信长对着三个脑袋是不会喝不下酒的。他反而得意洋洋地向人宣扬他的独特的暴力美学。在这个乱世之中，信长独特的生活经历养成了他乖戾暴躁的脾气，而他最终也死在他的性格上。
