巴赫一生没有等到王公贵族的青睐。真正青睐巴赫的是平民百姓。当时教堂音乐是给王公贵族听的，广大老百姓那时根本不是人，没有听音乐的资格。1729年３月，巴赫接手台杰非创立的“音乐学社”，指挥由学生和业余乐手组成的乐队和合唱团上演德、意音乐，举办户外合唱节，深受莱比锡人喜爱。巴赫喜欢走到乡村小教堂去弹奏那里简陋的管风琴。有个乡村管风琴师听了后对这位陌生人说：“您若不是伟大的巴赫，就是一位来自天堂的天使。只有他有这样的技艺。”
这是巴赫有生之年听到过的最高肯定。
商人，只有商人，才是推动封建社会前进的动力。1743年，莱比锡十六位棉布商在“音乐学社”基础上组建协会“音乐大会”（Das gro'e Concert）,约定每人资助一位音乐家，3月11日，第一场音乐会在“三天鹅”客栈举行。
此即莱比锡货栈乐团（Leipziger Gewandhausorchester）前身。它的建团历史仅次于德累斯顿乐团，名列德国老二。随着门德尔松、马勒和富尔特文格勒等著名指挥的相继加盟，它迅速成为世界一流乐团。
1747年6月，巴赫成为“音乐科学通讯学会”第十四名会员。1738年，巴赫学生米隆福创立这个协会，意在“把音乐变成科学，研究并理顺音乐史”，会员必须是作曲家或音乐理论家。前十三名会员中包括台杰非和亨德尔。
全世界巴赫迷对这个协会感激涕零，因为协会要求每个入会者提供一幅近期画像。巴赫交来的油画由莱比锡画家哈艾鹏创作。
这是全世界惟一一幅以巴赫本人为模特的油画。
此时已年过六旬的巴赫目力渐衰，人老体疲。但他的创作激情踏遍青山人未老。1748年８月，巴赫开始大规模创作赋格。他去世后，巴佳爱将这些作品结集出版。
《赋格的艺术》！（Die Kunst der Fuge BWV 1080）一部由十四部赋格和四部卡农组成的巨作。它涵盖了赋格所有的规则，是赋格音乐的顶峰，和结束。《赋格的艺术》从未按巴赫的设想完成，因为巴赫给自己订下的目标太高了。他要求演奏者的演奏技巧必须炉火纯青，却未规定用什么乐器来演奏。今天这部作品已经有键盘（羽管键琴、管风琴和钢琴）、弦乐四重奏和管弦乐团等多种演奏形式。
巴赫在巴亚蜜填房的第二年开始创作《赋格的艺术》上卷。下卷创作于十六年后任职莱比锡时期，断断续续地写了约四年之久。
赋格（Fugue）原意“追逐”，指曲中同一主题变化而来的三个以上旋律彼此应答，互相模仿。赋格使作品奔放多变，最适合能同时模仿各种乐器的管风琴。
卡农（Canon）原意“规则”，指后面声部按一定时间距离依次模仿前一声部的旋律。《黄河大合唱》中的《保卫黄河》和贝多芬的《命运交响曲》主题都是卡农。巴赫在管风琴合唱和声乐作品中经常使用卡农。
赋格和卡农是对位法的主要形式。对位法由尼德兰僧侣克巴德发明，原文为拉丁文punctus contra punctum（音符对音符），它是人类最古老的音乐创作技巧之一，指两条以上的旋律同时发声，彼此应答。
人类古老艺术多源自对位。北京潭柘寺门口的金刚力士，是佛的贴身侍卫长，按佛经本来只有一位，就是为了对位，生弄成一对，还一个张口，一个闭口，似乎分别在叫“哼”与“哈”，因此又称哼哈二将。
对位法与和声相反。和声有一个主旋律，其它旋律围绕主旋律，重点在于纵向发展；对位法有多条旋律，各声部相互独立，重点是横向发展。
对位法主要有模仿法和对比法。赋格是模仿法最高形式。
对位法的顶峰是巴洛克复调音乐。巴洛克复调音乐的顶峰是赋格。
巴赫，是赋格大师中的珠穆朗玛峰。
巴赫的赋格技巧精湛纯美，内容包罗万象，俄罗斯著名钢琴家鲁宾斯坦说：“仅在《平均律》中你就可以找到宗教性的、英雄气概的、忧郁的、雄伟的、哀诉的、幽默的、田园风味的、戏剧性的——各种各样的赋格曲”
巴赫的赋格空前绝后，它们逻辑严密，同时却结构均衡。这来自巴赫的和声。巴赫的赋格是复调与和声相结合的最高典范。
