为了准备台风行动，陆军司令部将8月从鲍克那里调走的部队又归还给他，补充了一些新的装甲部队。到9月晚些时候，中央集团军群总共集结了大约150万人和1000多辆坦克。部队被分成鲍克的三个步兵集团军，第2、第4和第9，以及三个装甲集群——赫曼·赫特将军第3装甲集群机动部队的大部分，从北方集团军群调来；海因茨·古德里安将军的第2装甲集群，由一个来自南方集团军群的特别装甲军加强；埃里希·霍普纳将军的第4装甲集群，从北方集团军群调来。经过如此增援，鲍克控制了苏联地区19个装甲师中的14个，14个摩托化步兵师中的8个，以及48个常规步兵师。另外，他可以获得阿尔伯特·凯塞林空军元帅第2航空队1000架飞机的支援，这是迄今为止德国空军在东线的一次最大规模集结。
但是，鲍克的数量优势具有欺骗性。三个半月的战争付出了重大代价，没有一支部队编制完整。到9月底，全部德军伤亡达到534 000人。甚至没有一个师达到满编的80%，绝大多数装甲团只有满编的75%或更少。士兵疲劳、肮脏并经常挨饿。
更糟糕的是，鲍克从未解决他的后勤问题。他目前距他在波兰的补充基地有400英里，而且每天需求34节车皮的物资来满足他巨大的消耗以及为进攻准备物资储存。甚至在奥尔沙至斯摩棱斯克的铁路被改为德国的窄轨后，补给一般也比标准降低了20%～40%。坦克和其他摩托化车辆的油料是一个特别严重的问题。摩托车油、轮胎和零部件也非常短缺。台风行动将要开始的15天前，第4集团军司令古恩特·汉斯·冯·克卢格元帅写道：“集团军几乎完全依赖铁路。此时，后者只能满足当前的消耗，部队生活只够糊口。”为了储存尽可能多的油料，鲍克中止运输食物，强迫士兵们部分地就地取食或者勒紧裤腰带。
9月29日，装甲部队和俯冲轰炸机发起“台风行动”的前一天，鲍克和凯塞林检查了德军的航空侦察报告。他们发现了许多变化。整个8-9月战事平静期间，苏联人一直忙于在莫斯科前方修筑防线。红军劳动营修建了三个漫长的防坦克壕沟带，后面是地堡，横贯预期的德军进攻线路，而且炮兵们把重炮推入地下防弹掩体里。第一条防线在莫斯科西南135英里的重要铁路中心维亚济马附近。内层防线叫作莫扎伊斯克防线，是以该防线中间一个镇子命名的，大部分是由妇女和老人修筑的。其他的变化从空中看不出来。苏联人还埋了成千上万颗地雷。而且斯大林的将军们，调来他们的战略预备队，在这些防线上集结了大约25万士兵。他们将很快得到来自遥远西伯利亚新锐师的支援。
这天晚上，鲍克召集他阴郁的高级指挥官们。“问题出现了，”克卢格的参谋长古恩特·勃鲁门特里特将军回忆道，“在苏联冬天来临之前是否还剩足够的时间让我们利用手头这些虚弱的部队占领莫斯科。”考虑到天气和有限的油料储备，鲍克定11月7日为包围莫斯科的底线。会议后，他给部队写了一篇檄文：“中央集团军群的士兵们，经过几个星期的等待，集团军群恢复进攻了！我们的目标不是别的，就是彻底消灭我们东面的残存敌军并且占领布尔什维克主义的堡垒——莫斯科。我相信你们将同以往一样自信勇敢地圆满完成你们的任务，让我们不要犹豫。让我们向最后的胜利进军。”
