另外，保加利亚境内的苏军以及希腊北部被保加利亚占领的马其顿地区已经切断了E集团军撤退的后路。
德军以一种令人惊叹的速度开始撤退。直到9月15日，希特勒才下令全面撤出罗得斯(希腊东南一城市)、克利岛以及希腊的其他岛屿，而且由于飞机不够用而一拖再拖。一直等到10月3日，魏克斯也没有得到任何解释，只好下令全面撤出希腊和阿尔巴尼亚。等到真正开始撤退的时候，一个星期的时间已经过去了。这时，英国军队分遣队已经在希腊南部登陆，还有成群的希腊游击队不停地骚扰撤退中的德军——就像在南斯拉夫一样，这些游击队也是由一些保皇派和左翼分子组成。
与此同时，苏军对南斯拉夫的进攻也开始了。9月22日，托尔布欣的第3乌克兰前线军先锋部队向西越过多瑙河开始进攻。他们将目标瞄准了贝尔格莱德，即塞尔维亚傀儡政府的首都，也是南斯拉夫战前的首都。短短两个星期，塞尔维亚东部地区满眼都是德意志帝国的敌人。驻扎在保加利亚和罗马尼亚南部的第3乌克兰前线军共派出了19个步兵师和500辆坦克。再往北，马林诺夫斯基手下第2乌克兰前线军的左翼部队横扫了塞尔维亚内陆地区。3支保加利亚军队在斯图卡式俯冲轰炸机的支援下，攻打位于贝尔格莱德东南125英里处的塞尔维亚城市尼斯。其勇猛的战斗精神令他们的前联盟德国大吃一惊。铁托游击队方面已经和贝尔格莱德南部红军的先头部队挂上钩了，第一批运到的武器包括100000支来复枪，68000门机械化大炮，还有一些武器将在几个星期内由苏联提供给他们。
F集团军从一开始就被判了死刑。不仅在数量上远远少于对手，而且大多数都是一些上了年纪的老兵，装备也极其简陋，既没有坦克，机动车辆也很缺乏。而魏克斯的所作所为，更是将它弄得支离破碎。尽管如此，战士们仍然顽强奋战。在前往贝尔格莱德的途中，德军的指挥官们将所有的步兵团、坦克和突击炮集中在一起，等苏军坦克开到足够近的区域，然后再将他们摧毁，直到德军自己被疯狂的敌军歼灭。由于苏军和保加利亚军队屡次切断铁路线，使得乘坐火车从希腊火速向北前来的德军增援部队颇费周折。一个师要花上整整两个星期的时间才到达贝尔格莱德，而正常的情况只需要一天的时间。
苏军的第一个目标，尼斯城，于10月15日被攻陷。4天以后，游击队开着苏联红军提供的坦克进入贝尔格莱德，这样一来，他们有权利向苏维埃要求优先权。铁托曾经说服了苏维埃，争取到官方同意让他们攻打南斯拉夫。游击队进攻南斯拉夫首都的残酷斗争早就开始了，经常是挨家挨户地进行扫荡。到了10月20日，游击队攻下整个城市，并宣布胜利。
当F集团军向后撤退，在贝尔格莱德西北斯瑞姆附近建立了新的阵线的时候，他们的战友，在希腊的E集团军正一点点地穿过南斯拉夫南部的马其顿省向北移动。他们于11月2日翻越了边境，是最后一支到达的部队。然后，在贝尔格莱德以南200英里处，斯科普里铁路中心附近，将苏军和保加利亚军队拖住了很长一段时间，确保成功地穿过克拉列沃，向西北方向撤退。但是，这样一来，撤退进展非常缓慢，导致人力上的极大浪费。由于飞机数量的限制，估计有30000名德国士兵和60000名意大利士兵滞留在克里特岛和希腊的其他一些岛屿上。
苏军攻下了塞尔维亚的大部分地区，大批人马继续向北进军匈牙利，将攻克南斯拉夫其他地区的任务交给了铁托的游击队。在匈牙利，苏军加入了自8月底以来就异常猛烈的战斗中，又一次在攻打德军南翼部队高潮迭起的战斗中和弗雷斯那尔的集团军交锋。
弗雷斯那尔奉命守卫的匈牙利至多只能算是一个不冷不热的同盟。匈牙利和纳粹德国的关系更多的是出于赤裸裸地对自身利益的考虑，而不是在政治上与德国“意气相投”。
