男儿若个愿从军。
可见他很害怕南方一些共和派成为“貂冠一代”，沉溺于“六朝金粉”，表示如果有人能领导北伐，他愿投军从战。后来袁世凯称帝失败，但北方更呈军阀割据的混乱局面，1924年，孙中山在广州正式发动国民革命，祖父立即奔赴广州，投身其中。他先在广州中山大学任教授，和共产党员毕磊过从甚密；后来北伐军挺进，他以军医身份一直在战地医院忘我救治伤员，一直跟随大部队打到武汉。没想到1927年发生了国民党以“清党”名义杀害共产党员的事变，祖父的挚友孙炳文和年轻的友人毕磊等都遇害，这使祖父陷入了更大的苦闷，他作成长诗《哀江南》，倾泻出一腔悲愤。1928年他来到上海，当年同盟会老战友赵铁桥在上海有个比较显赫的职务，赵支持他成立了“上海公学”，收容了不少在国共分裂后处境险恶的共产党员和国民党左派，大都是些二三十岁的年轻人。进入30年代，祖父埋头整理自己历年来的著作，在一份他遗留下来的墨迹中，开列着他整理好的著作书目：
鱼山丛书种类目
鱼山刘正雅著译
文学部附政治经济
《孔子墨子的国学新知验今录》一部共四卷（白话稿
已失）
《大道循环说》一卷（文言）
《礼乐论》一卷（文言）
《鬼神论》一卷（白话）
《人类生活论》一部二卷（白话）
《中华现代经济的农忙》一卷（白话）
《鱼山杂著》一卷（诗文集）
理学部
《宇宙大观》一部共三卷（文言）
《物理新编》一部（白话）
《化学新编》一部（白话）
医学部
《汉医汇究》一部共六卷（文言）
工学部
《分析化学》一部共二卷（文言?译）
《植物分析化学》一部共一卷（文言?译）
《制药化学》一部共一卷（文言?译）
《工业药品制造法》一部共一卷（文言?译）
《新药编》一部共一卷（文言?译）
这些译著，他在1931年都交给了商务印书馆，受到欢迎。商务印书馆拟首先出版《人类生活论》，这也是祖父自己最看重的一部著作，集中体现了他那来自个人生命体验和经历民族忧患后的深刻思索。本来，这些著作，会以《人类生活论》打头，在1932年陆续由商务印书馆印行的。相信这些著作一旦面世，起码会有一部分能在中国的文化思想史或出版史上留下痕迹。而且，由于“上海公学”的支持者赵铁桥遭到暗杀，不得不解散，祖父自己又中风偏瘫，经济上亦陷于了困境，也等待着商务印书馆出书获得生活与治疗的费用。万没想到，祖父在病榻上所等待到的不是散发着油墨香味的个人专著样书，而是日寇轰炸机掷下的炸弹！
祖父所住的医院被炸成了废墟，日寇消灭了他的肉体；更令我们后人思之愤然怆然的是，他的全部投往商务印书馆而尚未及印制的译著原稿，也在日寇弹火下化为了灰烬！
