虽然身为国民党党歌的曲作者，但是程懋筠却终身未入国民党。国民党内部很多人都劝说他加入国民党，但是都遭到了他的拒绝。他的生活不需要政治，他也不留恋官场，他只爱音乐，只是希望能够全心全意地做个音乐人。
在1949年那个风云变幻的岁月，以其对国民党执政时的民国音乐文化的贡献和社会影响，程懋筠有足够的资格和理由像其他一些文化人一样举家迁往台湾，李中和先生也曾特意安排程懋筠前去台湾。但是，安排妥当后，程懋筠却毅然决定留在中国大陆，然而，这个选择也直接使他成为中国近代音乐史上的“隐形人”。
因为他没有迁往台湾，所以，21世纪以来台湾音乐馆《资深音乐家丛书》出版了4辑36册装帧精美的音乐家传记，其中除收录台湾本土音乐家之外，还有一些自大陆（或国外）到台湾定居的音乐家，如戴粹伦、蔡继锟、萧而化、张昊、李抱忱、王沛纶、吴漪曼等，但是却把程懋筠排除在外。
虽然程懋筠留在了中国大陆，还曾带病冒雨和市民一起走上街头，欢迎中国人民解放军进入上海，满怀激情创作了词曲《新中国颂》发表在《上海音乐》创刊号上，并致力于新中国的音乐教育事业，后又加入“九三学社”，但由于他在国民党统治时期的民国音乐文化史上的作为，特别是因其为《中华民国国歌》的曲作者，所以在解放后强调阶级斗争的一段时期里，他在音乐舞台上也销声匿迹了。
就这样，在历史的转折过程中，在中华民国音乐文化界曾几何时名满天下的程懋筠，一度悲哀地被历史置于了遗忘的角落。也许，他本不该如此寂寞……
