又一次，一个学生在图画教室门口大声喊道：“李叔同哪里去了？”他并不知道老师就在隔壁，那个时候的师道尊严，如果直呼老师的名字，一般老师会接受不了甚至大发雷霆。可李叔同却只是和平时一样平静地问：“什么事？”而那个学生早就跑远了。
当时浙一师有个训导主任对学生态度粗暴，学生们普遍反感。有一次丰子恺因与他发生争执，最后两人动起手来，主任很是不满，就要求校方处理丰子恺，会上气氛很紧张，主任要求将丰子恺开除。在沉寂中李叔同发言了：“学生打先生，是学生不好，但是先生也有责任，因为他没有教育好。考虑到丰子恺平日遵守校规并无大错，如开除似太重，而且他又是个人才，将来必大有前途，如果开除则毁了他的前途，对国家是一损失。我意此番记一大过，我带他一道向主任赔礼道歉，不知大家是否同意？”此时会上一片同意声。事后，李叔同叫丰子恺等几人到他的房间，打开《人谱》，念了一段大意为学文艺时要更重视人格、道德修养的文字。
李叔同温和却不失严厉，他的教育方式被学生称为“爸爸的教育”，在同学中取得很好的效果。在别的学校里都是英语、国文等科占据重要地位，音乐、美术只是附属品，而在浙一师则刚好相反，同学们把这两科看得比英语、国文还要重，只因为教课的老师是李叔同。
李叔同善于因材施教。1912年冬的一天，身为学生的刘质平写下了平生第一首歌曲，这天适逢下大雪，但刘质平还是兴奋地将作品拿去给李叔同看。只见李叔同细阅一过，若有所思，并注视学生良久。刘质平以为老师怪罪自己急于求成，正在羞愧之中，忽听李叔同说道：“今晚8时35分，赴音乐教室，有话讲。”
晚上，雪越下越大，不时还刮着狂风。刘质平准时赴约，可他走到教室的走廊时，发现地上已有足迹，再抬头看看教室，室内一片漆黑，没有一点声响。于是，刘质平就一个人站在门外廊前等候。三分钟、五分钟、十分钟，忽然，教室内灯光亮了起来，门也打开了，从里面走出来的不是别人，正是早已到来的老师李叔同。只见李叔同手持一表，说相约时间无误，并告诉刘质平现在可以回去了。
刘质平没有想到，李叔同是在考验他是否守信认真。是晚刘质平冒着风雪大寒准时赴约，且待在教室门外等候达十分钟之久，李叔同认为他是一个肯吃苦的学生，心里十分满意。从此，他俩师生情谊日深。李叔同不仅自己每周课外单独指导他两次，还特意介绍他到当时在杭州的美籍鲍乃德夫人处学钢琴。
李叔同根据学生的资质进行不同的指导，培养出了一大批人才，如美术家丰子恺、潘天寿，音乐家刘质平、吴梦非，作家曹聚仁等。民国时期，在上海、浙江一带从事学校艺术教育的，很多是李叔同的弟子或再传弟子，用他提出的“以美淑世”思想，提高国人素质，为中国的教育做出了很大的贡献。
