1972年6月4日，杨奇清在秦城监狱接待室见到了分别多年的亲人。他从里面的一个小门出来，毛毛一眼就看到父亲，大声叫着。孩子们看到父亲的背驼了，面黄肌瘦，皱纹布满额头，走路变得蹒跚，十分辛酸。然而，杨奇清见到夫人与孩子们来了，非常高兴，一一询问他们的现状。孩子们实在不忍心告诉父亲有关家庭的艰难处境，只是敷衍地告诉他一切都很好，不想让父亲的愉悦心情蒙上一缕阴影。杨奇清嘱咐他们：“你们一定要相信党，相信组织，不要有抵触情绪，我的问题迟早会得到解决。”
见到杨奇清咳血，家人很紧张，为他的健康担心。杨清回忆说：“见面的时间仅一个小时。我们给父亲带来他爱吃的东西。毛毛把两块糖偷偷塞到父亲手上，被专案组人员看到，大声训斥弟弟，父亲又把糖还给毛毛，说：‘你替爸爸吃吧！’牢狱的迫害，能够摧残父亲的躯体，疾病可以侵蚀他儒雅阳刚的容貌，却未能改变他爽朗乐观的性格和脸上展现的淡定笑容。”
这年7月，杨奇清在狱中病情加重，咳血不止。这时，专案组才把他送到专门为监狱犯人看病的复兴医院住院。在周恩来总理的关心下，后被送到北京医院高干病房接受治疗。江青一伙及其在公安部的党羽对此深为恐慌，硬说成是“保外就医”，继续对杨奇清进行监视和迫害。
杨奇清出狱后，得知儿子杨波和女儿杨清分别上了大学，十分高兴。他仔细询问杨清所在班级的情况。女儿告诉他：“我所在的华师7304班有25人，党员3人、团员20人，有2名英语专业辅导老师和1名专业辅导员。”听后，杨奇清教导女儿：“政治上，你要积极要求进步，起骨干作用，多多与党员学生接触，关心班里同学，争取早日加入中国共产党。除此而外，还要刻苦学习专业知识，精通英语，现在外语干部极其缺乏，毕业后会大有作为的。”
杨奇清在生活上也关心孩子。杨清回忆说：“父亲没有给我买过新衣服，只是把以前的衣服装入纸箱，亲自写上我的名字和地址，寄往学校。当我收到纸箱，看到上面那熟悉的笔迹，心中感到无比温暖。”在学校，杨清积极参加各种活动，克服干部子弟身上的弱点，去湖北农村开门办学，接受党组织的各种考验。1976年，她终于如愿加入了中国共产党。当杨清把这一喜讯第一时间告诉父亲时，杨奇清特别高兴，自豪地说：“现在，我们不仅是父女关系，而是真正意义上的同志关系！”
杨奇清虽然出狱了，但问题一直没有解决。军代表派人在家门口24小时监视他。杨清记得，凡是来看望父亲的，要报名字，记车号。“部里的老同志就和监视的人捉迷藏，趁他们值班换岗的时候，偷偷到家里看望父亲。外地的同志纷纷打电话来问候。即使在这样艰难的情况下，父亲还是反复教育我们，不要有悲观情绪，要相信党、相信中央，他的问题一定会解决。困难的日子总会过去。我们就当是二度长征，咬牙坚持，光明就在前面。”
