当时不但李登辉积极运作，发动国民党全力留人，强调两蒋移灵兹事体大，不可轻率决定，时任国台办主任的唐树备也发表公开谈话，表示欢迎两蒋灵柩迁回大陆安葬，但时间应到两岸统一之后，且墓地选址也不是在南京钟山，而是浙江奉化溪口等其他地方。几经磋商，蒋纬国才收回成命，将移灵问题暂时拖了下来。不久，蒋孝勇与蒋纬国也先后辞世，移灵问题随之高搁。
蒋方良寂寞向晚
蒋经国过世时，蒋方良因为心脏病病情严重，在医生建议下留院观察，所以没见蒋经国最后一面。之后来七海探望蒋方良的政客、朋友也越来越少。紧接着蒋孝文、蒋孝武先后病逝，蒋孝章、蒋孝勇又长居海外，蒋方良将自己完全禁锢在七海官邸中独坐，没有笑容，心情落寞。有好几年，蒋方良不看病、不见客，整天待在屋子里。尤其 1996年蒋孝勇病逝，蒋方良再度走向由大直赴荣总的伤心路，更显得孤单。
在蒋经国多年的俭朴克难作风之下，蒋经国与蒋方良从来没有想到要为自己买些产业，手边积蓄也不多，以致她在晚年只靠抚恤金过活，生活条件已相当差。自1937年随丈夫到中国后，蒋方良未再见到故乡山水，也有人劝她回乡散心，但最后还是因阮囊羞涩而作罢。蒋方良最喜欢造访的地方是基隆八斗子。当地渔民为感谢蒋经国，特地在海边立了尊笑容可掬的铜像，蒋方良不时前往缅怀。一年三节和忌日，她都会前往头寮凭吊，在陵寝前静思良久。
其后，民进党去蒋风起云涌，陈水扁不但拆掉蒋纬国位于外双溪的别墅，还一度打算将大直海军总部内一大片池塘“四海潭”和周边划为公园，并纳入蒋方良所住的七海官邸，差点把蒋方良“扫地出门”，经军方力争才保住。当时蒋方良甚至担心地说，如果七海要被收回，“我只能住到头寮去了”。
2000年陈水扁当选，初期主打中间路线，慈湖、头寮保存如故。2004年 1月27日，蒋方良与蒋纬国遗孀蒋丘如雪共同具名盖章，写信给“防务部 ”部长汤曜明，希望让两蒋安厝至汐止五指山“国军示范公墓”，为两蒋移灵或奉安问题提出新说法。
当时正值
2004年大选前夕，“连宋配”一路看好，宋美龄则在美国亡故，因此蒋家以不愿续耗台湾财力、物力并履行两蒋勤俭作风为由，提出让两蒋入土为安的构想，以突显两蒋毕生以部属、军中同袍为重的精神。当时蒋方良还指定蒋纬国之子蒋孝刚为家属联系窗口，与“国防部”配合。
2004年 12月底，蒋方良走完孤单的人生路，遗体火化后移往头寮暂厝，七海陷入无声的寂静。与此同时，“三一九”两颗子弹改变了整个局势，蒋家自然也让迁葬念头冷了下来。反倒是陈水扁兴致勃勃地指示军方尽速办理，因此台湾“防务部”迅速编列新台币 2700万元预算打造五指山墓园两蒋墓区，号称“蒋陵”；并成立高阶人士组成的移灵奉安筹备委员会，准备大张旗鼓地把两蒋安葬之事搞定。
没想到一场大雨让通往陵寝的唯一道路发生了50年来仅见的泥石流，花了 10天才把道路打通，提案移灵的徐乃锦突然重病住院，四个月后离开人世。之后更因蒋家内部意见不一，已经更名的蒋孝严要求两蒋移灵不要在民进党“执政 ”时代举办，导致已完工的蒋陵延宕闲置至今。
2006年 7月间，马英九主政下的台北市政府，通过与蒋徐乃锦联系和专家鉴定后，宣布将蒋经国长年居住的七海官邸列为古迹，并正名为“七海寓所”。2007年7月，郝龙斌接任台北市市长，将七海改为蒋经国图书馆作为纪念。
