美方派人直接约谈汪希苓，其实就是变相的侦讯，还要求汪希苓说明此事有无向上级报告，宛如宗主国般，只是国民党理不直、气不壮，只能吞了下来。蒋经国的配合，成效依旧相当有限，反而令国民党当局形象不断受挫。台湾“中央研究院”10名院士还联合发表声明，要求蒋经国严惩真凶，否则不惜与国民党当局划清界限。
3月间，陈启礼友人张安乐（白狼）在美公布一份保命录音资料，宣布“蒋孝武就是谋杀江南的元凶”，虽无确切证据，却立即震惊海内外，也让形势越显复杂。
不过此时美方采取冷处理态度，通过渠道征询台湾是否愿意支持美国政策，秘密捐款给尼加拉瓜游击队。此时台湾与尼加拉瓜左派桑定政权还有“外交”关系，国民党随即通过外围组织，捐助了100万美元，获得美方赞许。
江南案速审速决，汪希苓与陈启礼等人被判无期徒刑。当年7月1日，蒋经国更下令取消涉案的情报局，将其与特情室合并，另组军事情报局，改由负责军政的参谋总长、原八军团司令卢光义指挥，并中止在美情报刺探等秘密工作。刘宜良遗孀崔蓉芝在美控告台湾当局一宜，最后也以获 145万美元赔偿和解了事。
一如蒋孝勇生前所说，江南案让蒋经国既生气又伤心，成为他心中之痛。蒋孝武虽然矢口否认，辩白自己背了黑锅，但是蒋经国随即把他从“中广”总经理位子上拉下来并调离台北，派往新加坡担任商务代表团副代表，接班成为泡影。
日后汪希苓证实，江南案的确不是蒋孝武下令安排的。张安乐也承认扯出蒋孝武是围魏救赵、担心陈启礼遭灭口的策略运用。但拉下蒋孝武已成既定事实。就在蒋孝武远赴新加坡后，蒋经国于1986年4月初，同意蒋孝武与第二任妻子蔡惠媚的亲事。两人远在新加坡结成连理，证婚人是驻新代表胡炘，蒋方良代表蒋经国为男方主婚人。历经蒋孝武与汪长诗婚姻风波，这段婚姻对晚年的蒋经国来说，总算是一件喜事
病情加剧，蒋孝勇崛起
同年，国民党秘书长蒋彦士遭撤换，由年过七旬的马树礼继任。民间传说是蒋经国不满蒋彦士辜负他私下托管蒋孝武，但真正的原因则是爆发了有六万多社员、存款170多亿台币的第十信用合作社非法放款倒闭案，导致挤兑人潮、民心动荡，舆论强烈挞伐当局放任政治人物与财团挂钩，在金融管制工作上放水。由于这是蒋经国最深恶痛绝的问题，所以包括蒋彦士在内，“财政部”部长陆润康、“经济部”部长徐立德两名财经首长一律被撤职查办，展现了蒋经国的铁腕依旧。
人事上，蒋经国对故旧根本不留情面，给人莫测高深、伴君如伴虎之感。熊丸曾说，情报来源很多的蒋经国，不知是否受了苏维埃教育影响，城府很深，“没人看得出他心里在想什么”，“大家都想尽量离他越远越好”。蒋孝勇也曾分析，蒋经国笃信“穷人一定不会贪污，孝顺者一定忠顺”，
据此提拔官员，但事后“看来，未必全对”。 1985年，蒋经国因糖尿病宿疾导致末梢神经坏死，不但走路时时常踩
空，甚或站立数分钟的体力都无法维持。虽然持续在做复健，但各国情治
系统都高度关注蒋经国的健康与接班问题。
好强的蒋经国先是换了手杖，无济于事后才不得已换坐轮椅。七海也重新扩建整修了一次，“国安局”还特地在落地窗后开通一条车道，让车子直达有电梯的书房，让蒋经国免于下楼梯之苦。卧室里则只简单摆设了一张可以升降的单人医疗床以及氧气瓶等一般的急救设备。
