408年的一天，慧观忽然回庐山了。同时和慧观一起来的是天竺高僧佛驮跋陀罗，还有四十几位僧人，都是高僧的弟子。佛驮跋陀罗又名觉贤，精通小乘理论，很早就以禅律驰名西域。在罽宾受到智严的邀请，历经三年，来到中国。到长安后，一度和罗什合作得很愉快，但很快有了分歧。姚兴站在罗什一边，还作出了处分的决定，将佛驮跋陀罗摈出长安，意思是不许佛驮跋陀罗在长安传教。
据说佛驮跋陀罗刚走，姚兴就知道错了，要人追回佛驮跋陀罗。
慧远以为不当对佛驮跋陀罗处分，当下就给姚兴和罗什二人写信，请他们纠正。数月后，昙邕带来回信，姚兴撤了对佛驮跋陀罗的处分。
据说佛驮跋陀罗终生不忘远公的知遇之恩，遗嘱圆寂后骨灰安放东林寺。其舍利塔建在东林寺，是历史上第一位葬在庐山的外国僧人。
慧远对佛的神圣情感，非我等俗人能够想象。佛经上说天竺有佛的影像，经过流沙大流漠再向西一万五千八百五十里，在一个石室中。慧远对佛影很关切，甚至很想去瞻仰，可惜年纪大了，走不动了。天竺来的僧人说见过佛影，极为光明赫烁。
慧远听说后，很为兴奋，请了工匠，在一处傍山川又临水的地方，营筑龛室。然后又让妙手画工画了佛影，“淡彩图写，色疑积空，望似烟雾，晖相炳琼，若隐若现”。慧远又让远在京师的谢灵运作了《佛影铭序》，对佛影做了赞颂。
413年，慧远已经80岁了，但身体还不错，每天还要坚持修持。
忽然传来罗什在长安圆寂的消息，慧远很悲痛。罗什比他小十岁，却提前往生了。又听说罗什的尸骨火焚后，惟有舌头不焦，又欣慰了。他着手将和罗什的通信，编成了一本书，叫《问大乘中深义十八科》并《罗什答》二卷。后改名为《大乘大义章》流通于世。
416年八月六日，慧远大师圆寂。为自己的佛教人生画上了圆满句号。
大师临终前，弟子们请饮豉酒和米汁，都不许。念半截经，就辞世了。年八十三。
慧远去世后，谢灵运至为悲痛，挥毫作了《庐山慧远法师诔》，其序中说：“可谓五百之季仰绍舍卫之风；庐山之，俯传灵鹫之旨，洋洋乎未曾闻也。”绍，继承。舍卫和灵鹫，佛经常讲经的地方。，盘曲不平。
