8月上旬，陈诚的所有中枢职务全被免去——政治部部长（张治中继任）、三青团书记长（此职早在1938年9月就由国民党中央秘书长朱家骅代理）。理由是陈诚兼职太多，不利于专心于第六战区的军事。陈的免职，多少含有处分的意思。但陈诚说，免职对他来说是一种解脱。在临时受命前往宜昌指挥作战时，他就给蒋介石写了一封信，提出“准职解除党政方面之职责”，专心前方军事。
“职分属军人，杀敌报国是其天职，无论就性能与所学，均当以军事为本分。若复滥竽党政，不仅不自量其所短，亦且重荒其天职。当此抗战建国、千钧一发之秋，职所念念不忘者，即为对此民族百世之冤仇，应作锲而不舍之奋斗，自不容一曝十寒、分心外骛，更不愿以有限之精力与时间，自陷于无谓之纠纷与摩擦……在前方军事方面，尚可竭诚尽忠，负一部分之责任；而在后方党政方面，则无能为力，亦无法为力。凡此皆属实在情形，实不容长此自欺欺人、一误再误也。职外怵于抗战之大计，内恫于奉职之无方，清夜思量，难安方寸。用敢直陈，贡其信守。仍乞钧座俯赐鉴察，于最短期内，物色政治部及青年团之替人，准职解除党政方面之职责，而于军事方面，力图自赎，以免长此贻误。”
8月上旬，陈诚就任第六战区司令长官后，又写信再提前请。
“……职自抗战以来，东奔西驰，前后靡定，数年经过，本身职务既已荒旷，所负使命复多挫失，虽承钧座视犹子侄，曲予宽容，但人言啧啧，内省多疚，拟恳此后无论前方或后方，予以专责，稍图报称。职之所以一再吁请，喋喋不能自已者，非不知仰体钧座之忧烦，稍存自便之念，实求对事有效、于国有补，以报钧座，而赎前愆耳。”①
陈诚有自知之明。虽然中枢职务权重威大，但并不都是讨好的差事。这两年，陈诚多次受蒋临时派遣，东奔西驰，受人嫉视，甚至有人讥诮他是“党政上之游击”，亦即“党政上之疟疾”者。他认为党政工作非自己所长，还是希望在前方指挥抗战。
至此，陈诚结束了两年多的政工生涯，转入军事和地方政治。
第六战区前后有两个，前一个第六战区成立于1939年10月，为防止敌人进攻湘西而设。陈诚兼任了一段时间长官后，便由商震接任。次年4月，该战区被撤销。
1940年夏成立的第六战区，辖境包括鄂西、鄂中、鄂南、湘北及湘西、川东、黔东等地，进可以反攻宜昌，光复武汉，退可以拱卫川、黔，保障陪都安全。其重要性大有后来居上之势。蒋介石曾在一次重大会议上，提出“军事第一”、“第六战区第一”的口号，可见对第六战区的“厚爱”。
陈诚在回忆录里写道：“自摆脱中枢职务以后，得以专心致志于第六战区的工作，这是多年求之不得的梦想，现在居然实现了，心里稍感自慰。然一念及伴同专职而来的专责——拱卫陪都——又不免感觉惶恐，因为这责任毕竟是太大了。”
此后四五年，陈诚在第六战区指挥部和湖北省政府所在地——鄂西的恩施落了脚，专心做军事和地方工作。
